動(dòng)物科技學(xué)院辦學(xué)歷史悠久，淵源于1917年南京高等師范所設(shè)農(nóng)科，是國(guó)內(nèi)最早設(shè)立的一個(gè)畜牧獸醫(yī)高等教育單位。1921年在南京高等師范的基礎(chǔ)上成立的東南大學(xué)正式設(shè)立畜牧系，1927年?yáng)|南大學(xué)更名為中央大學(xué)，新中國(guó)成立后中央大學(xué)更名為南京大學(xué)。1952年全國(guó)高等院校調(diào)整成立南京農(nóng)學(xué)院，由原南京大學(xué)農(nóng)學(xué)院的畜牧獸醫(yī)系和浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)院的畜牧獸醫(yī)系合并成立南京農(nóng)學(xué)院畜牧獸醫(yī)系，分設(shè)畜牧、獸醫(yī)兩個(gè)專(zhuān)業(yè)。1983年畜牧獸醫(yī)系分開(kāi)，成立畜牧系和獸醫(yī)系。1994年畜牧系更名為動(dòng)物科學(xué)系，1996年正式成立動(dòng)物科技學(xué)院。

學(xué)院設(shè)有動(dòng)物繁殖科學(xué)系、動(dòng)物遺傳育種科學(xué)系、動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料科學(xué)系、智慧畜牧與環(huán)境科學(xué)系、水產(chǎn)科學(xué)系。現(xiàn)有教職工134人（專(zhuān)任教師90人），其中教授45名、副教授37名，博導(dǎo)42人、碩導(dǎo)82人；國(guó)家自然科學(xué)基金杰出青年基金獲得者1人、優(yōu)秀青年基金獲得者3人、優(yōu)秀青年基金（海外）獲得者3人，現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學(xué)家2人，教育部新世紀(jì)人才1人、青年骨干教師3人，江蘇省杰出青年基金獲得者1人，江蘇現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席專(zhuān)家2人、崗位專(zhuān)家8人，江蘇省特聘教授2人，江蘇省“六大高峰人才” 2人、333高層次人才工程培養(yǎng)對(duì)象7人、青藍(lán)工程中青年學(xué)術(shù)帶頭人2人、骨干教師培養(yǎng)計(jì)劃2人、教學(xué)名師1人、雙創(chuàng)博士1人，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)鐘山學(xué)者計(jì)劃首席教授4人、學(xué)術(shù)骨干7人、鐘山學(xué)術(shù)新秀9人。

擁有畜牧學(xué)學(xué)科博士點(diǎn)和1個(gè)博士后流動(dòng)站，4個(gè)二級(jí)博士點(diǎn)、4個(gè)二級(jí)碩士點(diǎn)，畜牧學(xué)在第五輪學(xué)科評(píng)估中獲評(píng)B+，現(xiàn)為江蘇省“十四五”優(yōu)勢(shì)學(xué)科。本科設(shè)有動(dòng)物科學(xué)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、金善寶書(shū)院實(shí)驗(yàn)班（動(dòng)物科學(xué)動(dòng)物生產(chǎn)方向）、卓越農(nóng)林復(fù)合應(yīng)用人才班。動(dòng)物科學(xué)和水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)為國(guó)家一流本科專(zhuān)業(yè)建設(shè)點(diǎn)。開(kāi)設(shè)國(guó)家一流本科課程虛擬仿真課程1門(mén)、在線課程1門(mén)、線下課程1門(mén)、線上線下混合式課程1門(mén)、國(guó)家級(jí)精品課程2門(mén)、視頻公開(kāi)課1門(mén)、資源共享課2門(mén)、省級(jí)精品在線開(kāi)放課程3門(mén)。在校本科生800余名，研究生600余名。

建有動(dòng)物科學(xué)類(lèi)國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、國(guó)家動(dòng)物消化道營(yíng)養(yǎng)國(guó)際聯(lián)合研究中心、教育部科技部?jī)?yōu)良畜禽品種選育與品質(zhì)提升學(xué)科創(chuàng)新引智基地、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部牛冷凍精液質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心（南京）、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物生理生化重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（共建）、江蘇省動(dòng)物消化道基因組國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、江蘇省家畜遺傳材料保存與創(chuàng)新利用中心、江蘇省消化道營(yíng)養(yǎng)與動(dòng)物健康重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省動(dòng)物源食品生產(chǎn)與安全保障重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省水產(chǎn)動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省家畜胚胎工程實(shí)驗(yàn)室、江蘇省奶牛生產(chǎn)性能測(cè)定中心。擁有中華絨螯蟹“金農(nóng)1號(hào)”水產(chǎn)品種。近五年，累計(jì)到賬科研經(jīng)費(fèi)2億余元，主持部省級(jí)及以上科研項(xiàng)目200余項(xiàng)，在國(guó)際優(yōu)秀期刊發(fā)表論文1000余篇，新增50余項(xiàng)專(zhuān)利授權(quán)，以第一完成單位獲部省級(jí)及以上科技獎(jiǎng)勵(lì)6項(xiàng)。與國(guó)內(nèi)20多家知名企業(yè)建立緊密合作關(guān)系，每年獎(jiǎng)學(xué)、獎(jiǎng)教金達(dá)40余萬(wàn)元。

注重交流及合作，先后與美、英、法、德、丹麥、加拿大、澳大利亞、荷蘭、日本等國(guó)20多所大學(xué)建立合作關(guān)系；與廣西大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院簽訂對(duì)口合作協(xié)議；依托動(dòng)物消化道營(yíng)養(yǎng)國(guó)際聯(lián)合研究中心，與蒙古、巴基斯坦、伊朗等10國(guó)高校代表簽署建立“一帶一路”畜牧科技創(chuàng)新聯(lián)盟備忘錄，與埃塞俄比亞阿瓦薩大學(xué)、泰國(guó)孔敬大學(xué)、坦桑尼亞索科尼農(nóng)業(yè)大學(xué)等7所高校簽署雙邊合作協(xié)議。

學(xué)院在百年的發(fā)展歷史中，動(dòng)物科學(xué)各領(lǐng)域取得了一批豐碩的部省級(jí)以上教學(xué)和科研成果，為國(guó)家培養(yǎng)了3000多名本科生與研究生，其中包括中國(guó)工程院院士任繼周和劉守仁在內(nèi)的一大批高級(jí)專(zhuān)門(mén)人才。