音樂學系于2016年5月伴隨浙江音樂學院的成立正式建系，是我院音樂理論研究和教育教學的重要部門。系部共有在編教師23人，其中正高級職稱9人，副高級職稱12人。音樂學系承擔音樂學5年制本科專業(yè)人才培養(yǎng)和音樂與舞蹈學下設七個研究方向的研究生教育。我系分設四個教研室：中國音樂史、西方音樂史、民族音樂學、藝術學理論。目前有國家級課程3門，省級一流課程7門，系部教師團隊獲省級教學成果一等獎、二等獎各一項，承擔省部級以上在研科研課題15項。“為中國音樂事業(yè)培養(yǎng)專業(yè)的音樂理論人才”是音樂學系一貫堅持的人才培養(yǎng)目標，以研究中西音樂文化為主導，以傳承中國優(yōu)秀傳統(tǒng)音樂文化為核心。通過教學、科研等多重方式，使我院音樂學系能夠在全國音樂學領域發(fā)揮引領作用。