2014年9月，中國藥科大學優(yōu)化學科布局、完善學科生態(tài)群，整合分散于藥學院、生命科學與技術學院、理學院的工學相關學科，成立工學院。學院以工程技術為支撐、教學科研型學院為發(fā)展定位，圍繞藥物研發(fā)各環(huán)節(jié)、交叉融合特色鮮明，努力向“小而精”方向發(fā)展，“小”即重點發(fā)展，“精”即高水平建設。

學院現(xiàn)有教職工114人（專任教師81人、博士后10人），在讀學生1331人（本科948人、碩士325人、博士58人），下設制藥與環(huán)境工程系、食品營養(yǎng)與安全系、生物醫(yī)學工程與診斷藥學系和GMP實訓中心。專任教師中，正高級職稱15人，副高級職稱45人，博士生、碩士生導師48人。學院教師通過整合科研資源，凝練科研萬向，不斷進取創(chuàng)新，近五年成功獲批教育部智能制藥工程研究中心、國家重點研發(fā)計劃、國家自然基金重大國際（地區(qū)）合作基金、國家自然基金重點項目、國家重大科研儀器研制項目、海外及港澳學者合作研究基金、國家自然基金優(yōu)秀青年基金、江蘇省杰出青年科學基金等項目。

學院目前設有3個本科專業(yè)：制藥工程、食品營養(yǎng)與健康（食品質量與安全）、環(huán)境科學?，F(xiàn)有藥學（制藥工程學）藥學類二級學科博士學位、碩士學位授權點，生物醫(yī)學工程一級學科碩士學位授權點，制藥工程、生物與醫(yī)藥專業(yè)學位授權點。

學院建有符合新版《藥品質量管理規(guī)范》（GMP）的實訓中心，為省級學科綜合訓練中心，運行固體制劑、注射劑、凍干粉針、生物制藥、中藥提取、藥物合成和公用工程等七個車間（生產(chǎn)線），總建筑面積達4800平方米，其中凈化面積3600平方米，是集規(guī)?；?、系統(tǒng)化、信息化于一體的實踐教學及工藝優(yōu)化平臺。

學院科研氛圍濃厚，建有生物檢測實驗平臺、化學合成實驗平臺，制藥工程實驗中心、分子生物學實驗中心、微生物實驗中心、分離純化技術實驗中心、色譜儀器實驗中心、藥物分子影像中心等；學院擁用先進的儀器設備，包括小動物核素SPECT/CT成像系統(tǒng)、生物透射電鏡TEM等大型儀器，為學院的教學、科研提供了有力的支持。

學院發(fā)展定位：以工程技術為支撐、服務于醫(yī)藥發(fā)展、學科交叉融合、藥學特色鮮明的高水平工學院。學院將利用學校藥學學科優(yōu)勢，開拓創(chuàng)新，圍繞藥物研發(fā)各環(huán)節(jié)，在學科內涵和平臺建設、人才培養(yǎng)與教學設計、科研氛圍營造與方向凝練、師資隊伍整合和人才引進等方面積極創(chuàng)新。