上外亞非語種教學的歷史可追溯至1951年4月開設的東南亞語文系，該系師生后并入北大東語系。1960年上外增設阿拉伯語專業(yè)。1997年上外阿拉伯語系、朝鮮語專業(yè)、波斯語專業(yè)合并成立東方語學院。學院現設阿拉伯語、朝鮮（韓國）語、波斯語、泰語、印度尼西亞語、越南語、希伯來語、土耳其語、印地語、斯瓦希里語、柬埔寨語等11個專業(yè)；還開設馬來語、烏爾都語、爪哇語、梵語、世界語、古典敘利亞語、巽他語、巴列維語、古典希伯來語、奧斯曼土耳其語等非通用語課程。

學院的專業(yè)從屬于阿拉伯語言文學、亞非語言文學兩個學科點，均設有碩士點、博士點和博士后流動站，均被列入“雙一流學科”建設名單。2007年，阿拉伯語語言文學專業(yè)被評為國家重點（培育）學科和上海市重點學科。本院阿拉伯語、朝鮮語、波斯語、希伯來語、土耳其語、印地語、泰語等7個本科專業(yè)列入國家級一流本科專業(yè)建設點（中央賽道）。2019年學院更新了室內外裝修，為廣大師生提供了優(yōu)美舒適的教學科研環(huán)境。

學院踐行學校倡導的“懂外語、通國家、精領域”的“多語種+”高端國際型人才培養(yǎng)機制。在本科階段，學院力推“7+1”的國際化辦學模式，即學生在上外學習的8個學期中，7個學期在上外學習，1個學期在語言對象國大學深造。在碩士研究生階段，學生可在第二年前往倫敦大學亞非學院、萊頓大學等非對象國知名大學進修或者修讀課程碩士。學院與本校的高翻學院、法學院、新聞學院、金貿學院、聚力培養(yǎng)諸如多語種全球新聞、多語種法律、多語種金融、多語種國際貿易、阿拉伯語口譯、朝鮮語口譯、波斯語MTI項目等“多語種+”高端人才。上外多語種法律碩士項目已與盈科（曼谷）律師事務所、上海正策律師事務所（河內分所）、埃及帝博律師事務所簽訂教學科研基地協(xié)議。在博士研究生階段，學生可以在二年級到對象國或非對象國收集材料，目前正在與國外知名高校商談聯合培養(yǎng)計劃。

此外，學院結合各專業(yè)特點，聯合上外全球治理與區(qū)域國別研究院、語言研究院、絲路戰(zhàn)略研究所、全球文明史研究所，結合已有的海外合作院校關系推出“亞非國別區(qū)域研究特色研究生項目”和“阿拉伯國家研究特色研究生項目”，其中“亞非國別區(qū)域研究特色研究生項目”下設“亞非歷史文化”（古代近東史、中東史、南亞與東南亞史）、“絲路學”（絲路文化交流史、帶路伙伴關系發(fā)展現狀、絲路學理論與方法）、亞非語言政策研究三個方向。完成該特色項目論文答辯的學生除還可獲得學位證、畢業(yè)證外，還可以在通過規(guī)定項目考核后，獲得學校出具的國別區(qū)域特色研究生項目證書。

2012年，2012年學院在摩洛哥王國卡薩布蘭卡市哈桑二世大學設立了孔子學院，向摩洛哥各界宣傳中國文化。2017年2月，由東方語學院發(fā)起，上外加入由8所國內外大學組成的亞非研究國際聯盟（Consortium for Asian and African Studies, CAAS），其余7所為：法國東方語言文化研究學院、日本東京外國語大學、荷蘭萊頓大學、新加坡國立大學人文與社會學院、英國倫敦大學亞非學院、美國哥倫比亞大學和韓國外國語大學。2019年承辦了該聯盟第10屆年會。

本院堅持“育人為本、德育為先”的教育理念，持續(xù)完善“全員育人、環(huán)境育人、文化育人”的特色育人體系，先后出色完成了APEC上海峰會、上海世博會、世界游泳錦標賽、亞信峰會、進博會等大型國際性賽會的志愿者服務工作。