基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院是我校較早設(shè)立的教學(xué)管理機(jī)構(gòu)，成立于1985年3月，其前身為基礎(chǔ)部，負(fù)責(zé)全校各專業(yè)、各層次基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)相關(guān)課程（公共課程和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)課程）的教學(xué)管理工作。隨著學(xué)校辦學(xué)規(guī)模擴(kuò)大及教學(xué)管理機(jī)構(gòu)調(diào)整，后更名為基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部，2016年12月更名為基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，負(fù)責(zé)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)相關(guān)課程的教學(xué)管理、科研管理、師資培養(yǎng)、研究生教育管理等工作。

學(xué)院下設(shè)7個(gè)教研室，2個(gè)實(shí)驗(yàn)中心，現(xiàn)有教職工140人，其中專任教師110人（包括教授23人，副教授45人，講師36人），研究生導(dǎo)師59人。擁有安徽省優(yōu)秀教師1人，安徽省教學(xué)名師7人，安徽省優(yōu)秀教育工作者1人，安徽省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人選4人，安徽省教壇新秀7人。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)為一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，下設(shè)人體解剖與組織胚胎學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、病原生物學(xué)、免疫學(xué)、醫(yī)學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)細(xì)胞生物學(xué)與遺傳學(xué)等6個(gè)二級(jí)學(xué)科授權(quán)點(diǎn)。病原生物學(xué)為省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科，生理學(xué)、人體解剖學(xué)、醫(yī)學(xué)寄生蟲學(xué)和病理學(xué)為校級(jí)重點(diǎn)學(xué)科。有感染與免疫、組織移植2個(gè)安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室?，F(xiàn)有研究生110人。近5年來，各學(xué)科點(diǎn)共承擔(dān)國家級(jí)及省級(jí)等科研項(xiàng)目200余項(xiàng)，發(fā)表學(xué)術(shù)論文近300篇，并與國內(nèi)外多所高校及科研院所開展學(xué)術(shù)交流。

學(xué)院目前承擔(dān)全校30個(gè)專業(yè)本科生基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)課程理論及實(shí)驗(yàn)教學(xué)任務(wù)，現(xiàn)有省級(jí)精品課程4門，省級(jí)精品資源共享課程5門，省級(jí)慕課14門，省級(jí)智慧課堂1門，省級(jí)課程思政示范課程3門。建設(shè)有省級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心1個(gè)，省級(jí)虛擬實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心1個(gè)，省級(jí)課程思政建設(shè)中心1個(gè),教學(xué)實(shí)驗(yàn)室40余間。擁有實(shí)驗(yàn)室面積約5000平方米，專業(yè)教學(xué)儀器設(shè)備總價(jià)值6000余萬元。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院黨委下設(shè)8個(gè)教工黨支部，現(xiàn)有黨員92名。學(xué)院黨委注重發(fā)揮政治核心作用，充分發(fā)揮黨支部的戰(zhàn)斗堡壘作用及共產(chǎn)黨員的先鋒模范作用，不斷加強(qiáng)制度建設(shè)和師德師風(fēng)建設(shè)，深入推進(jìn)“課程育人、科研育人、實(shí)踐育人、文化育人、管理服務(wù)育人”工作，形成了以課程育人、科研育人為特色的育人體系。廣大教師以習(xí)近平新時(shí)代中國特色社會(huì)主義思想為指導(dǎo)，全面貫徹黨的教育方針，堅(jiān)持“四個(gè)回歸”，投身黨的教育事業(yè)，堅(jiān)持立德樹人、教書育人，為培養(yǎng)德智體美勞全面發(fā)展的社會(huì)主義建設(shè)者和接班人而努力奮斗。