蚌埠市醫(yī)學(xué)院的院系蚌埠醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)一系的前身——醫(yī)療系（后更名為臨床醫(yī)學(xué)系），設(shè)置于1958年，是蚌埠醫(yī)學(xué)院創(chuàng)辦最早的傳統(tǒng)專業(yè)。五十余年的辦學(xué)歷程中，培養(yǎng)了中國工程院院士劉德培、中國科學(xué)院院士段樹民等大批的醫(yī)學(xué)人才。2004年，臨床醫(yī)學(xué)系一分為三，分別設(shè)立臨床醫(yī)學(xué)一系、二系和臨床教學(xué)部。該系堅持“以生為本”的教育理念，以“育白衣天使，樹杏林英才”為主線開展學(xué)生專業(yè)培養(yǎng)、思想教育和日常管理工作。下設(shè)6個學(xué)生年級，有工作人員18人，在校學(xué)生兩千余人。