醫(yī)學(xué)工程技術(shù)學(xué)院組建于2003年，2004年開設(shè)第一個專業(yè)信息管理與信息系統(tǒng)；2008年開設(shè)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)；2021年開設(shè)全國首個生物醫(yī)藥數(shù)據(jù)科學(xué)專業(yè)，2022年獲批生物醫(yī)學(xué)工程一級學(xué)科碩士點。建院以來，學(xué)院共培養(yǎng)了4000余名優(yōu)秀醫(yī)工交叉人才，為邊疆少數(shù)民族地區(qū)社會穩(wěn)定、經(jīng)濟發(fā)展、文化繁榮、醫(yī)療服務(wù)、人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、民生福祉、邊疆鞏固做出了重要貢獻。

學(xué)院堅持醫(yī)工交叉、醫(yī)理融合、服務(wù)醫(yī)療的辦學(xué)理念，目標建設(shè)成為西部地區(qū)一流、國內(nèi)有一定知名度和影響力的醫(yī)工交叉學(xué)院。近年來，醫(yī)學(xué)工程技術(shù)學(xué)院一步一個腳印，幾十年如一日為醫(yī)學(xué)教育事業(yè)服務(wù)，成為新疆醫(yī)工人才培養(yǎng)與科學(xué)研究的重要基地。經(jīng)過多年的薪火相傳，學(xué)院在黨建引領(lǐng)、教育教學(xué)、科學(xué)研究、人才培養(yǎng)和社會服務(wù)等方面深度融合、全面發(fā)展。學(xué)院2018年獲批“全國黨建工作樣板支部”，2021年獲“自治區(qū)先進基層黨組織”、“自治區(qū)高校黨組織‘對標爭先’黨建工作標桿院系”。

學(xué)院以生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)為基礎(chǔ)，積極發(fā)展信息管理與信息系統(tǒng)和生物醫(yī)藥數(shù)據(jù)科學(xué)專業(yè)。學(xué)科交叉特色明顯，多學(xué)科融合協(xié)調(diào)發(fā)展，不但擁有學(xué)校醫(yī)學(xué)教育的師資與科研條件，同時也具備工科及相關(guān)學(xué)科的師資隊伍及實驗設(shè)施，便于學(xué)科間知識的轉(zhuǎn)化與融合，實現(xiàn)交叉創(chuàng)新。

學(xué)院設(shè)教研室7個（數(shù)學(xué)教研室、計算機軟件教研室、計算機應(yīng)用教研室、信息科學(xué)教研室、醫(yī)用物理教研室、醫(yī)用電子教研室、生物醫(yī)學(xué)工程教研室），實驗中心2個（物理實驗中心、計算機實驗中心），研究機構(gòu)2個（生物醫(yī)學(xué)工程研究所、生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)研究中心）。學(xué)院現(xiàn)有教職工78人，其中教授11人，副教授15人；博士生導(dǎo)師5人、碩士生導(dǎo)師30人、高級實驗師6人。

學(xué)院現(xiàn)有生物醫(yī)學(xué)光學(xué)、醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)、生物信息、醫(yī)學(xué)圖像處理等五個研究團隊，已建成我區(qū)首個生物醫(yī)學(xué)光學(xué)平臺。近三年，院獲國家自然科學(xué)基金項目10項。省部級項目38項。發(fā)表科研論文152篇，其中SCI收錄68篇、核心期刊65篇。榮獲新疆維吾爾自治區(qū)科技進步二等獎1項，自治區(qū)優(yōu)秀科技論文獎2項。

學(xué)院立足新疆，面向全國，培養(yǎng)德才兼?zhèn)?、基礎(chǔ)扎實、善于實踐、勇于創(chuàng)新、綜合素質(zhì)高、社會責任感強的醫(yī)工交叉應(yīng)用研究型人才。我們將高舉習(xí)近平新時代中國特色社會主義思想偉大旗幟，深入學(xué)習(xí)貫徹黨的二十大精神，完整準確貫徹新時代黨的治疆方略，緊緊圍繞新疆醫(yī)科大學(xué)黨委中心工作，肩負“健康中國”戰(zhàn)略歷史使命，不忘初心、矢志奉獻，努力培養(yǎng)好黨和國家滿意的醫(yī)工交叉人才，為建設(shè)新時代中國特色社會主義新疆貢獻力量。