新疆維吾爾自治區(qū)兒童醫(yī)院前身為新疆交通醫(yī)院，始建于1984年。自成立之初至今，歷經(jīng)新疆交通醫(yī)院（1984年至2005年）、自治區(qū)人民醫(yī)院北院（2006年至2017年）、自治區(qū)兒童醫(yī)院（2018年至今）三個(gè)階段。2016年，自治區(qū)黨委、政府決定：依托自治區(qū)人民醫(yī)院，在自治區(qū)人民醫(yī)院北院基礎(chǔ)上建設(shè)“新疆維吾爾自治區(qū)兒童醫(yī)院”。經(jīng)過(guò)幾年的轉(zhuǎn)型發(fā)展，自治區(qū)兒童醫(yī)院已成功轉(zhuǎn)型為一所集醫(yī)、教、研、預(yù)防保健等為一體的三級(jí)綜合兒童醫(yī)院。

自治區(qū)兒童醫(yī)院位于烏魯木齊市阿勒泰路393號(hào)，距離機(jī)場(chǎng)10公里，毗鄰烏魯木齊站，交通便利。占地面積2.66萬(wàn)㎡，建筑面積5.84萬(wàn)㎡。

醫(yī)院設(shè)有13個(gè)行政職能科室；19個(gè)臨床科室（其中外系科室13個(gè)、內(nèi)系科室6個(gè)），9個(gè)醫(yī)技科室，1個(gè)兒研所。醫(yī)院共有在職職工790人，其中醫(yī)生210人，護(hù)士361人，醫(yī)技44人。正高級(jí)職稱40人，副高級(jí)職稱75人，中級(jí)職稱185人，博士及碩士83人。

目前，醫(yī)院開(kāi)放床位539張。2020年，診療17.37萬(wàn)人次，出院患者1.17萬(wàn)人次，手術(shù)3737例。2020年業(yè)務(wù)收入3.95億元，醫(yī)院總資產(chǎn)7.51億元，固定資產(chǎn)凈值4.44億元。

醫(yī)院擁有GE1.5T核磁共振、西門(mén)子 64排螺旋CT、GE16排螺旋CT、GE彩色多普勒診斷儀、日立生化分析儀、萊卡手術(shù)顯微鏡、費(fèi)森尤斯床旁血液濾過(guò)機(jī)、奧林巴斯高清電子胃腸鏡、史賽克電子腹腔鏡等高端醫(yī)療設(shè)備，為高效、便捷、準(zhǔn)確的診斷和治療提供了強(qiáng)有力的保障。