維吾爾醫(yī)學(xué)院的前身是2006年成立的維吾爾醫(yī)藥系，開辦維醫(yī)學(xué)專業(yè)本科教育，并于當(dāng)年招生。2012年4月，維吾爾醫(yī)藥系更名為維吾爾醫(yī)學(xué)院。2012年9月，維醫(yī)學(xué)作為中醫(yī)學(xué)的二級學(xué)科招收碩士研究生。

學(xué)院下設(shè)綜合管理辦公室、教學(xué)科研辦公室（教師發(fā)展中心）、學(xué)生管理工作辦公室、維醫(yī)基礎(chǔ)教研室、維醫(yī)臨床教研室和實(shí)驗(yàn)中心6個部門。現(xiàn)有1個自治區(qū)級“勞模工匠創(chuàng)新人才工作室，1個校級“雙帶頭人”黨支部。

學(xué)院擁有一支志在“用胡楊精神育人 為興疆固邊服務(wù)”的師資團(tuán)隊，有專任教師15人，外聘教師33人，實(shí)驗(yàn)教輔教師2人。1人榮獲全國“五一”獎?wù)拢?人榮獲全國民族醫(yī)藥先進(jìn)工作者，1人獲得自治區(qū)級教學(xué)名師，1人獲得校級教學(xué)能手。

維醫(yī)學(xué)在臨床實(shí)踐中對心血管疾病、皮膚病、婦科疾病等具有特色診療方法和顯著療效。學(xué)院依托我校良好的教學(xué)、科研環(huán)境大力發(fā)展維醫(yī)學(xué)專業(yè)，現(xiàn)擁有5所維醫(yī)學(xué)專業(yè)教學(xué)醫(yī)院，1所產(chǎn)學(xué)研教學(xué)基地。

學(xué)院現(xiàn)有在研國家級、省部級、廳局級項(xiàng)目8項(xiàng)，資助科研經(jīng)費(fèi)220萬。

學(xué)院秉承立德樹人、為黨育人、為國育才的教育理念，立志為邊疆醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)培養(yǎng)一批熱愛傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)，具備良好的職業(yè)道德、綜合素質(zhì)、傳承創(chuàng)新能力及終身學(xué)習(xí)能力的應(yīng)用型醫(yī)學(xué)人才。本專業(yè)畢業(yè)學(xué)生不但需要掌握必要的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)知識技能，還需要了解中華傳統(tǒng)醫(yī)藥發(fā)展源流，熟練掌握維醫(yī)學(xué)特色理論和診療技術(shù)。學(xué)院在校生272人，近三年平均就業(yè)率為96.9%，畢業(yè)生現(xiàn)已成為天山南北民族醫(yī)藥事業(yè)的中堅力量。