江西農(nóng)業(yè)大學生物科學與工程學院由生物技術(shù)研究開發(fā)中心和微生物教研室合并組建。1998年開始招收微生物專業(yè)本科生，1999年開始招收生物工程專業(yè)本科生，并成立生物工程系，2006年更名為生物科學與工程學院。2003年開始招收碩士研究生。建院系以來，共培養(yǎng)本科、碩士畢業(yè)生近4000人，學院生源來自全國30個?。ㄖ陛犑小⒆灾螀^(qū)）?，F(xiàn)有在校本科生1149人，碩士研究生202人。

學院現(xiàn)有教職工79人。其中，省部級人才10人，博士生導師7人，碩士生導師35人；具有高級職稱33人，外聘兼職教授11人；擁有博士學位57人。學院現(xiàn)有4000㎡實驗室和3000㎡現(xiàn)代化教學實訓基地，設(shè)備總資產(chǎn)3500多萬元。擁有江西省農(nóng)業(yè)微生物資源開發(fā)與利用工程實驗室、江西省菌物資源保護與利用重點實驗室2個省級重點實驗室，南昌市發(fā)酵應用技術(shù)重點實驗室、南昌市生物資源保護與利用重點實驗室、南昌市動物病毒與基因工程重點實驗室、南昌市食藥用菌重點實驗室4個市級重點實驗室，以及7個校級研究機構(gòu)、1個省級實驗教學示范中心、1個校級實驗教學示范中心等教學與科研平臺。

學院現(xiàn)有生物工程、制藥工程和生物技術(shù)3個本科專業(yè)。生物工程專業(yè)在2015年江西省高校專業(yè)綜合評價中位列本專業(yè)第一，2018年入選“江西省一流優(yōu)勢專業(yè)”，2019年入選國家一流專業(yè)建設(shè)點，制藥工程專業(yè)在2017年全省專業(yè)綜合評價中位列本專業(yè)第二。生物技術(shù)專業(yè)為省級特色專業(yè)。2020年省一流專業(yè)驗收獲評“優(yōu)秀”。制藥工程2022年被評為江西省一流特色專業(yè)。2022年生物工程專業(yè)在江西省第二輪專業(yè)綜合評價中排名第二，獲評“四星專業(yè)”。學院擁有生物學、生物工程兩個一級學科，設(shè)有微生物學、細胞生物學、生物化學與分子生物學、生物物理學及生物工程學術(shù)型碩士學位授權(quán)點以及生物與醫(yī)藥領(lǐng)域工程碩士專業(yè)學位授予點。其中，生物學為江西省“十二五”重點學科與示范性碩士點，?！笆濉敝攸c建設(shè)學科和博士點建設(shè)學科，生物工程學科為?！笆濉敝攸c學科和博士點建設(shè)學科。

學院堅持學科與專業(yè)、教學與科研緊密結(jié)合、協(xié)調(diào)發(fā)展。積極推進“本科生導師制”，構(gòu)建與完善教學與科研平臺的保障體系，注重師資隊伍建設(shè)與學生實踐能力培養(yǎng)。曾獲江西省教學成果二等獎3項，出版專著3部，主編或副主編教材6部。近年來，學院教師主持73項國家級和96項省級科研項目；獲江西省科技成果二等獎3項、三等獎2項，歐美同學會(中國留學人員聯(lián)誼會)第二屆“雙創(chuàng)”大賽三等獎1項，江西省高?？萍汲晒?、二、三等獎6項；授權(quán)國家發(fā)明專利11項；在SCI源刊及國內(nèi)核心期刊發(fā)表論文400余篇。

學院狠抓學風建設(shè)，注重學生綜合素質(zhì)培養(yǎng)。考研升學率始終名列全校前茅，2023年考研升學率率達46.64%。近年來，在“創(chuàng)青春”、“挑戰(zhàn)杯”以及“互聯(lián)網(wǎng)+”大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽中獲得國家級、省級和校級多項榮譽。曾獲全國“情系三農(nóng)”微電影大賽冠軍、全國大學生英語競賽江西賽區(qū)特等獎、全國大學生創(chuàng)業(yè)計劃大賽銅獎、全國農(nóng)業(yè)高校黨建論文論壇一等獎、大學生全國品酒大賽優(yōu)勝獎、江西省大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽金獎和銅獎、江西省生物技能大賽一等獎等多種獎勵。暑期三下鄉(xiāng)實踐團隊獲評全國“千校千項”最美團隊。學生工作多次獲得學校表彰，多次榮獲就業(yè)工作先進集體，取得校黨團知識競賽第一名、校運動會團體總分第三名等優(yōu)異成績。