經(jīng)浙江省教育廳批準，溫州醫(yī)科大學分別在2002年和2005年開始招收中醫(yī)學和中藥學專業(yè)本科生，2023年12月兩個專業(yè)整合正式成立溫州醫(yī)科大學中醫(yī)藥學院。學院總體定位為教學研究型學院，以本科、研究生教育為主，教學與科研并駕齊驅。

中醫(yī)藥學院目前擁有中西醫(yī)結合、中藥學兩個一級學科碩士點；中醫(yī)、中藥2個本科專業(yè)。目前學院有在校本科生357人，在讀研究生48人。學院有中醫(yī)藥研究生培養(yǎng)基地聯(lián)盟10家；附屬中醫(yī)院：東陽中醫(yī)院；溫州醫(yī)科大學中西醫(yī)結合醫(yī)院等，有浙江省立同德醫(yī)院、永嘉縣中醫(yī)院、昆山市中醫(yī)院等二十家省內外教學醫(yī)院；浙江省中醫(yī)院、溫州市中醫(yī)院、瑞安市中醫(yī)院等二十余家實習醫(yī)院，保證中醫(yī)、中藥的教學、見習和實習。

學院擁有優(yōu)質的師資力量，在校教職工107人，教師博士學位26人，占比24%；碩士學位60人，占比56%；教師高級職稱43人，占比40%，中級職稱38人，占比36%，博士生導師5人，碩士生導師23人。學院擁有全國名老中醫(yī)藥專家學術經(jīng)驗指導老師7人，全國名老中醫(yī)藥專家學術經(jīng)驗繼承人5人，浙江省國醫(yī)名師2人，浙江省名中醫(yī)19人，浙江省基層名中醫(yī)17人，市級名中醫(yī)43人。中醫(yī)學學科帶頭人程錦國教授為全國名老中醫(yī)藥專家學術經(jīng)驗繼承指導老師、全國名老中醫(yī)藥專家傳承工作室專家、浙江省省級名中醫(yī)浙江省中醫(yī)重點學科(腎病學) 帶頭人。