學校于1958年8月由浙江醫(yī)學院從杭州分遷至溫州后，便成立基礎學科教研組，1984年批準成立基礎部，2000年1月，基礎部、社科部、德育教研室、體育部組建為基礎學院，2005年9月正式成立基礎醫(yī)學院。

基本概況。學院現(xiàn)設病原生物學與免疫學系、生理學與病理生理學系、形態(tài)學系、機能學系、生物科學系、法醫(yī)學系6個系，下設16個教研室，現(xiàn)有基礎醫(yī)學國家級實驗教學示范中心，省級重點實驗教學示范中心機能實驗教學中心，省科普教育基地人體科學館和為市級示范教學形態(tài)實驗教學中心?，F(xiàn)有浙江省腫瘤相關(guān)病原與宿主互作研究國際科技合作基地和溫州市腫瘤相關(guān)病原與免疫重點實驗室。參與溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院共建全省智慧+腫瘤生物標志物研究與轉(zhuǎn)化重點實驗室。

師資隊伍。學院現(xiàn)有教職工174人，其中專任教師和專職研究人員共130人，正高級職稱26人、副高級職稱39人；具有博士學位者87人。近五年，新進博士學位教職工35人?，F(xiàn)有浙江省教學團隊醫(yī)學機能學教學團隊，3個教學團隊入選市級本科高等院校教師教學創(chuàng)新團隊?，F(xiàn)有國務院政府特殊津貼貼獲得者2人，現(xiàn)有省“萬人計劃”、省領軍人才、省高等學?！板X江學者”特聘教授、省杰青、省151人才工程等一批人才。

專業(yè)建設。學院承擔了全校（包括仁濟學院）全日制本?？萍傲魧W生教學，截至目前，共有國家級一流課程2門，教育部來華留學英語授課品牌課程1門，國家級虛擬仿真實驗教學項目1項，省級一流課程43門，省級虛擬仿真實驗教學項目8項。學院在上世紀80年代就開始招收碩士研究生，2001年病理學與病理生理學增列為碩士點，2011年獲批基礎醫(yī)學碩士學位授權(quán)一級學科，2018年獲批基礎醫(yī)學本科專業(yè)和博士學位授權(quán)一級學科，形成本碩博相銜接的人才培養(yǎng)體系?，F(xiàn)有基礎醫(yī)學和法醫(yī)學2個本科專業(yè)，基礎醫(yī)學本科專業(yè)2020年首次招生，獲批省級“一流本科專業(yè)”，法醫(yī)學專業(yè)為“十三五”新興特色專業(yè)，并招收基礎醫(yī)學專業(yè)碩、博士留學生。學院現(xiàn)有在校生規(guī)模達296人，其中本科生111人，碩士生164人，博士生21人。學院教師指導學生參加第七、八、九屆全國大學生基礎醫(yī)學創(chuàng)新研究暨實驗設計論壇，獲金獎3項，銀獎6項，銅獎2項，學校連續(xù)兩年獲高校優(yōu)秀組織獎。

學科建設。肺心病學是最早的浙江省高校重點扶植學科A類（1998年），生理學是浙江省高校A類重點學科（2009年），病原生物學為溫州市高校重點學科（2009年），基礎醫(yī)學學科為浙江省“十二五”高校重點學科（2012年）和浙江省“十三五”B類一流學科（2016年）?；A醫(yī)學學科入圍2022軟科中國最好學科排名和2022軟科世界一流學科，世界排名位列第401－500區(qū)間，支撐學校10個相關(guān)學科進入ESI前1%。

科學研究。圍繞學科建設重點形成了低氧醫(yī)學、病原生物與免疫、組織修復與再生醫(yī)學、神經(jīng)生物醫(yī)學、腫瘤學等5個研究方向。自2016年以來，學院共獲國家級項目50項，省部級項目71項，研究成果獲省部級科研成果獎勵8項，其中浙江省進步獎一等獎2項。

國際合作。學院積極開展國際學術(shù)交流與合作，先后與美國NIH、澳大利亞昆士蘭大學、澳大利亞莫納什大學、加拿大阿爾伯塔大學、韓國全南大學、意大利圣心大學等建立長期的友好合作關(guān)系。

注：其中的數(shù)據(jù)截至2024年4月