內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院始建于1977年，其前身為內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系?，F(xiàn)設(shè)有藥學(xué)、臨床藥學(xué)、中藥學(xué)、藥物制劑、制藥工程、中藥資源與開發(fā)6個本科專業(yè)和藥品生產(chǎn)技術(shù)1個專科專業(yè)。除制藥工程專業(yè)外，其余本科專業(yè)均為一本招生。藥學(xué)專業(yè)通過了教育部首批藥學(xué)專業(yè)認(rèn)證；中藥學(xué)為國家級特色專業(yè)；藥學(xué)、藥物制劑為自治區(qū)品牌專業(yè)。學(xué)院現(xiàn)有藥學(xué)及中藥學(xué)2個一級學(xué)科碩士研究生授權(quán)點，藥學(xué)碩士研究生授權(quán)點涵蓋6個二級學(xué)科。從2012年開始，與天津中醫(yī)藥大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)中藥學(xué)（民族藥學(xué)方向）博士。2014年，獲批藥學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點，同年，獲批內(nèi)蒙古自治區(qū)教育廳“研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地”建設(shè)項目。

學(xué)院現(xiàn)有教學(xué)科研及管理人員128人，其中教授25人，副教授23人；具有博士學(xué)位32人，博士生導(dǎo)師2人（與天津中醫(yī)藥大學(xué)聯(lián)合招生）、學(xué)術(shù)型碩士生導(dǎo)師45人，專業(yè)型碩士生導(dǎo)師19人。1人獲全國優(yōu)秀教師、全國師德標(biāo)兵榮譽稱號，5人獲自治區(qū)級教學(xué)名師、教壇新秀等榮譽稱號，24人次獲自治區(qū)杰出人才、突出貢獻中青年專家、草原英才等人才稱號。獲批自治區(qū)高等教育教學(xué)成果一等獎1項、自治區(qū)教學(xué)成果三等獎1項?，F(xiàn)有自治區(qū)一流課程2門，自治區(qū)優(yōu)秀教學(xué)團隊2個，自治區(qū)草原英才科技創(chuàng)新團隊1個。

學(xué)院現(xiàn)有14個專業(yè)教研室，5個實驗教學(xué)中心（自治區(qū)級、校級實驗教學(xué)示范中心各1個），3個科研中心。學(xué)院所屬內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)藥用植物園和藥用植物數(shù)字標(biāo)本館分別被納入國家藥用植物園和藥用植物數(shù)字標(biāo)本館建設(shè)體系。新藥安全評價研究中心是自治區(qū)從事藥物臨床前安全性評價的唯一專業(yè)機構(gòu)，可承擔(dān)藥理、毒理、病理、臨床檢驗等研究工作。儀器測試中心具有高分辨質(zhì)譜儀、核磁共振儀、超高效液相儀、高效液相儀等大型儀器設(shè)備30余臺，價值2000余萬元。

學(xué)院與國內(nèi)外科研院所、制藥企業(yè)有著廣泛的合作與交流。與美國、日本等國家及港、澳地區(qū)多所大學(xué)建立了合作關(guān)系。與天津天士力藥業(yè)、上海寶龍藥業(yè)、北京奧和藥物研究院、內(nèi)蒙古大唐藥業(yè)有限公司和赤峰天奇藥業(yè)等10余家區(qū)內(nèi)外企業(yè)聯(lián)合開展人才培養(yǎng)、藥物研發(fā)等工作。

截至2020年，在研項目75項，在研經(jīng)費2564余萬元；其中國家自然科學(xué)基金項目14項，內(nèi)蒙古自治區(qū)重大項目2項，重點項目7項。近5年，發(fā)表期刊論文295篇，其中44篇SCI（單篇最高影響因子11.3）；出版學(xué)術(shù)專著30余部；獲授權(quán)發(fā)明專利6項、實用新型專利65項。獲自治區(qū)科技進步一等獎1項，自治區(qū)自然科學(xué)二等獎2項，自治區(qū)青年科技獎1項。

截至2021年，已培養(yǎng)本?？飘厴I(yè)生7324人、碩士畢業(yè)生391人，現(xiàn)有在校本?？粕?311人、碩士研究生118人。