動物科技學(xué)院是石河子大學(xué)成立較早的院系之一、傳統(tǒng)優(yōu)勢學(xué)院之一。1959年，兵團(tuán)農(nóng)學(xué)院成立，設(shè)置畜牧獸醫(yī)系，當(dāng)年開始招生。1979年，更名為石河子農(nóng)學(xué)院畜牧獸醫(yī)系。1994年，更名為石河子農(nóng)學(xué)院動物科學(xué)系。1996年，合并成立石河子大學(xué)，下設(shè)農(nóng)學(xué)院動物科學(xué)系。2001年，成立石河子大學(xué)動物科技學(xué)院。

學(xué)院下設(shè)動物科學(xué)系、動物醫(yī)學(xué)系2個系和實(shí)驗(yàn)中心、教學(xué)試驗(yàn)站、教學(xué)動物醫(yī)院3個教輔機(jī)構(gòu)。學(xué)院現(xiàn)有教職工127人，教授31人，國家級人才3人。學(xué)院現(xiàn)有本科生1000余人，研究生300余人。

學(xué)院開設(shè)有動物醫(yī)學(xué)、動物科學(xué)2個本科專業(yè)，均入選國家一流專業(yè)建設(shè)點(diǎn)。動物醫(yī)學(xué)為國家級特色專業(yè)，動物科學(xué)專業(yè)入選教育部“卓越農(nóng)林人才教育培養(yǎng)計劃改革”試點(diǎn)項(xiàng)目（拔尖創(chuàng)新型）。畜牧學(xué)為一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和博士后流動站，獸醫(yī)學(xué)為一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。“動物生產(chǎn)與疾病控制”是國家“211工程”重點(diǎn)建設(shè)項(xiàng)目。畜牧學(xué)和獸醫(yī)學(xué)均為自治區(qū)高原學(xué)科。學(xué)校臨床醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、化學(xué)、植物與動物科學(xué)4個學(xué)科進(jìn)入ESI全球前1%。

學(xué)院緊緊圍繞國家和區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展需求，聚焦新疆及兵團(tuán)優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)開展科學(xué)研究和社會服務(wù)?！笆濉逼陂g，學(xué)院積極承擔(dān)國家、兵團(tuán)重大科研任務(wù)，扎實(shí)開展科技成果轉(zhuǎn)化和社會服務(wù)。立項(xiàng)省部級以上項(xiàng)目50余項(xiàng)，其中國家自然基金25項(xiàng)。轉(zhuǎn)化科技成果10余項(xiàng)，累計轉(zhuǎn)化金額3000余萬元。獲兵團(tuán)科學(xué)技術(shù)突出貢獻(xiàn)獎2項(xiàng)，兵團(tuán)科技進(jìn)步一、二、三等獎各1項(xiàng)。

學(xué)院廣泛開展對外交流合作，先后與美國、俄羅斯、哈薩克斯坦、新西蘭等國家的大學(xué)和科研機(jī)構(gòu)建立了良好的合作關(guān)系。學(xué)院充分利用華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)等高校對口支援、學(xué)科援疆契機(jī)，深化國內(nèi)交流合作，并與新疆天康、泰昆集團(tuán)等企業(yè)，以及兵地單位部門建立友好合作關(guān)系。

學(xué)院擁有良好的教學(xué)科研平臺和條件。成立11支科研團(tuán)隊(duì)，有“動物健康養(yǎng)殖”國家級國際聯(lián)合研究中心、教育部“綿羊健康養(yǎng)殖與人獸共患病防控”協(xié)同創(chuàng)新中心等9個省部級以上科研平臺。學(xué)院新建有2萬余平方米教學(xué)科研辦公樓、3千余平方米教學(xué)動物醫(yī)院和高標(biāo)準(zhǔn)教學(xué)動物試驗(yàn)站。

新征程上，學(xué)院將始終秉承“以兵團(tuán)精神育人，為維穩(wěn)戍邊服務(wù)”辦學(xué)特色，堅持“學(xué)科立院、人才強(qiáng)院、科研興院、依規(guī)治院”的發(fā)展戰(zhàn)略，全力建設(shè)“活力、實(shí)力、魅力”學(xué)院，奮力建設(shè)特色鮮明的高水平研究型學(xué)院。