江南大學(xué)生物工程學(xué)院是我國發(fā)酵工程學(xué)科的誕生地，源頭可追溯至20世紀(jì)30年代初，國立中央大學(xué)農(nóng)科農(nóng)化系食品發(fā)酵學(xué)術(shù)方向。中國第一代發(fā)酵學(xué)科泰斗魏喦壽、陳騊聲、金培松、秦含章、朱寶鏞等均曾執(zhí)教于此，為我國釀造微生物學(xué)研究和人才培養(yǎng)做出開拓性貢獻(xiàn)。一脈相承的南京大學(xué)食品工業(yè)系發(fā)酵組、南京工學(xué)院發(fā)酵工學(xué)專業(yè)匯集了中國最為優(yōu)秀的一批發(fā)酵專家學(xué)者。深厚的歷史傳承和大師級人物的領(lǐng)銜使得1958年建設(shè)的無錫輕工業(yè)學(xué)院發(fā)酵工程學(xué)科從發(fā)軔就站在了巨人的肩膀上。1984年，原無錫輕工業(yè)學(xué)院成立發(fā)酵工程系，開啟了學(xué)院辦學(xué)的新篇章。1995年，隨著無錫輕工大學(xué)更名，發(fā)酵工程系更名為生物工程學(xué)院。2001年，三校合并新組建的江南大學(xué)成立，原無錫教育學(xué)院、江南學(xué)院部分師資并入生物工程學(xué)院。

學(xué)院創(chuàng)建了我國第一個發(fā)酵工程國家重點(diǎn)學(xué)科及完善的本碩博人才培養(yǎng)體系，以及輕工技術(shù)與工程博士后流動站，是我國輕工生物技術(shù)與發(fā)酵工程領(lǐng)域中最具品牌影響力和競爭力的高等教育基地。學(xué)院不斷優(yōu)化以發(fā)酵工程和糖工程為核心的輕工技術(shù)與工程、基于工程生物學(xué)驅(qū)動的生物工程的雙峰學(xué)科布局。輕工技術(shù)與工程一級學(xué)科在2009、2012、2017年教育部學(xué)科評比中位居全國并列第一、第二和A+，2017年、2021年連續(xù)入選我國“雙一流”建設(shè)學(xué)科。

學(xué)院始終堅持“江南特色、世界一流”的核心理念，明確“謀大勢、帶隊伍、建能力、開新局”的建設(shè)思路，堅持面向世界科技前沿、堅持面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場、堅持面向國家重大需求、堅持面向人民生命健康。以創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展，立足生物工程產(chǎn)業(yè)，努力打造具有國際視野的一流師資隊伍，積極探索輕工生物類高水平復(fù)合型人才培養(yǎng)模式，推進(jìn)基礎(chǔ)科學(xué)研究突破和重大成果轉(zhuǎn)化落地，形成了“善于實踐、勇于創(chuàng)新”的特色學(xué)科文化，保持學(xué)科可持續(xù)發(fā)展的比較優(yōu)勢。

學(xué)院擁有一支包括中國工程院院士、國家杰出青年基金獲得者、國家級引進(jìn)人才、國家特殊支持計劃教學(xué)名師及領(lǐng)軍人才等在內(nèi)的國家級拔尖人才師資隊伍?，F(xiàn)有專任教師173名，正高69名，副高73名。

近五年來，學(xué)院主持包括國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目等在內(nèi)的國家和省部級課題300余項。其中，主持國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目10項、政府間國際合作項目2項、課題25項；國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體項目1項、重點(diǎn)項目5項、優(yōu)秀青年基金3項。主持企業(yè)橫向項目700余項，其中千萬級橫向項目27項，形成了“百企千司聚江南”的協(xié)同創(chuàng)新集群效應(yīng)。學(xué)院年度科研經(jīng)費(fèi)2018年首次突破1億元，2020年突破2億元，近5年科研總經(jīng)費(fèi)達(dá)到10.32億元，縱向與橫向平衡發(fā)展，經(jīng)費(fèi)比例約為1:1。近5年，在Nat Chem Biol、Nat Commun、Sci Adv、Proc Natl Acad SciUSA、J Am Chem Soc和J Cell Biol等國際期刊發(fā)表SCI論文1600余篇。年均獲授權(quán)發(fā)明專利300余項，其中國際專利20余項，在生物制造領(lǐng)域發(fā)明專利家族數(shù)位居全球前列。先后獲國家技術(shù)發(fā)明二等獎9項，國家科技進(jìn)步二等獎1項，中國專利金獎1項、銀獎2項。

學(xué)院擁有國家級優(yōu)質(zhì)教學(xué)資源，包括國家生命科學(xué)技術(shù)人才培養(yǎng)基地（基地班）、國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)等，是教育部卓越工程師計劃首批試點(diǎn)專業(yè)之一。學(xué)院設(shè)有生物工程（國家級特色專業(yè)、江蘇省品牌專業(yè)）、生物技術(shù)（國家級特色專業(yè)）、釀酒工程（國內(nèi)首個）三個本科專業(yè)，均入選國家一流專業(yè)建設(shè)行列?；匕嗖捎帽?碩-博貫通式招生培養(yǎng)。學(xué)院擁有輕工技術(shù)與工程博士后流動站，輕工技術(shù)與工程一級學(xué)科學(xué)術(shù)學(xué)位博士授權(quán)點(diǎn)（發(fā)酵工程、制糖工程），生物學(xué)一級學(xué)科學(xué)術(shù)學(xué)位碩士授權(quán)點(diǎn)（微生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)），生物與醫(yī)藥專業(yè)學(xué)位碩士、博士授權(quán)點(diǎn)（博士招生專業(yè)為發(fā)酵工程、碩士招生專業(yè)為生物技術(shù)與工程和發(fā)酵工程）。學(xué)院年招收本科生240余名，碩士和博士研究生450余名。迄今為止已為社會培養(yǎng)輸送各類人才16000余名。

學(xué)院十分重視國際學(xué)術(shù)交流與合作。通過“引進(jìn)一流專家、打造一流平臺”，持續(xù)與美國、德國、日本、法國、加拿大、荷蘭、韓國等多所國立大學(xué)建立了密切的合作和交流關(guān)系，取得了一批標(biāo)志性成果。近年來，承擔(dān)國家重點(diǎn)研發(fā)計劃國際合作重點(diǎn)項目3項、國家外專局高端外專項目4項。學(xué)院與英國布里斯托大學(xué)達(dá)成本科“2+2”合作辦學(xué)協(xié)議。高等學(xué)校學(xué)科創(chuàng)新引智計劃“應(yīng)用微生物及其生物制造技術(shù)學(xué)科創(chuàng)新引智基地”獲評“優(yōu)秀”順利通過教育部驗收，并獲得滾動支持。

學(xué)院建有工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實驗室、糖化學(xué)與生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實驗室、江蘇省現(xiàn)代工業(yè)發(fā)酵協(xié)同創(chuàng)新中心，共建了糧食發(fā)酵與食品生物制造國家工程研究中心、食品科學(xué)與資源挖掘全國重點(diǎn)實驗室、食品合成生物技術(shù)教育部工程研究中心、江南大學(xué)未來食品科學(xué)中心，為學(xué)科建設(shè)、科學(xué)研究和一流人才培養(yǎng)奠定了堅實基礎(chǔ)。

學(xué)院堅持“立德樹人”根本任務(wù)，牢記初心為黨育人為國育才，大力實施“黨建示范創(chuàng)建與質(zhì)量創(chuàng)優(yōu)”工程，入選首批“全國黨建工作標(biāo)桿院系”、首批全國高?！鞍賯€研究生樣板黨支部”、第二批全國高?！鞍倜芯可h員標(biāo)兵”，第三批“全國黨建工作樣板支部”。2015年獲評“全國模范職工小家”，2019年榮獲“全國教育系統(tǒng)先進(jìn)集體”，2022年入選“全國高校黃大年式教師團(tuán)隊”。