體育系前身為1952年建立的華東水利學(xué)院體育教研室，1985年成立體育系。體育系設(shè)有體育教育第一教研室、體育教育第二教研室、體育教育第三教研室、群體競賽教研室、軍事理論教研室等5個(gè)教學(xué)機(jī)構(gòu)，體育科學(xué)研究所、國防教育研究中心2個(gè)研究類機(jī)構(gòu)。2020年常州體育教學(xué)部正式并入體育系，實(shí)現(xiàn)教學(xué)、科研和管理一體化。體育系承擔(dān)著全校本科生體育課程教學(xué)、軍事理論教學(xué)、體育教育訓(xùn)練，碩士研究生教學(xué)、體育科研、學(xué)生和教職工群體健身與校內(nèi)外體育競賽活動(dòng)、高水平運(yùn)動(dòng)隊(duì)建設(shè)、校園陽光體育文化建設(shè)、對(duì)外體育文化交流和學(xué)生體質(zhì)健康標(biāo)準(zhǔn)測評(píng)與管理等工作任務(wù)。認(rèn)真貫徹德智體美勞全面發(fā)展的教育方針，努力開拓創(chuàng)新，在體育學(xué)科發(fā)展、體育教學(xué)、體育科研、運(yùn)動(dòng)競賽、群眾體育等方面進(jìn)行了探索和實(shí)踐，取得豐碩成果。曾獲全國群眾體育先進(jìn)單位稱號(hào)、江蘇省教學(xué)成果二等獎(jiǎng)及河海大學(xué)教學(xué)成果特等獎(jiǎng)等榮譽(yù)；學(xué)校體育工作多次被省教育廳授予“貫徹《學(xué)校體育工作條例》優(yōu)秀學(xué)?！睒s譽(yù)稱號(hào)。

河海大學(xué)是全國首批創(chuàng)建高水平運(yùn)動(dòng)隊(duì)學(xué)校，實(shí)施“體教結(jié)合”發(fā)展戰(zhàn)略，把體育訓(xùn)練、體育教育與人才培養(yǎng)有機(jī)結(jié)合。男子足球、健美操、乒乓球等運(yùn)動(dòng)項(xiàng)目水平位于全國高校前列。高水平足球隊(duì)近十年共獲得2次全國總冠軍，6次全國總決賽亞軍，1次全國總決賽季軍，7次全國南區(qū)冠軍。乒乓球隊(duì)近五年獲得世界杯比賽、世界錦標(biāo)賽（砂板）第一名各1次，第三名1次；全國性大學(xué)生錦標(biāo)賽獲第一名1次，獲第二名2次，第三名7次。健美操隊(duì)在歷年的全國健美操錦標(biāo)賽和冠軍賽上都屢獲佳績，在全國范圍內(nèi)有效地提高了河海大學(xué)的知名度。

河海大學(xué)體育系2021年體育學(xué)一級(jí)學(xué)科碩士授權(quán)點(diǎn)獲批通過，2022年運(yùn)動(dòng)訓(xùn)練本科專業(yè)獲批招生，現(xiàn)有碩士生導(dǎo)師11人。在職教職工72人，其中，教學(xué)科研人員67人。全系正高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)4人，副高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)27人。專任教師中具有博士學(xué)位5人，2人在職攻讀博士學(xué)位。

體育系以提高學(xué)生身心素質(zhì)為抓手，積極營造文明、健康、積極向上的校園體育文化氛圍；建立以人才培養(yǎng)、學(xué)科建設(shè)、科學(xué)研究、隊(duì)伍管理、場地建設(shè)等為支撐的學(xué)校體育工作體系，全面提升學(xué)校體育在培養(yǎng)創(chuàng)新人才中的作用。