水文水資源學(xué)院前身為1952年建立的華東水利學(xué)院水文系；1984年更名為水資源水文系；1995年，學(xué)校內(nèi)部機(jī)構(gòu)調(diào)整，水資源水文系和環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院合并，成立水文水資源及環(huán)境學(xué)院；2002年，調(diào)整為水資源環(huán)境學(xué)院；2007年更名為水文水資源學(xué)院。

1952年著名水文學(xué)家劉光文教授等創(chuàng)建新中國(guó)第一個(gè)水文系，1954年，創(chuàng)建我國(guó)第一個(gè)陸地水文本科專(zhuān)業(yè)，并于1955年開(kāi)始招收研究生，是我國(guó)第一批培養(yǎng)研究生的學(xué)科點(diǎn)。1981年首批獲得學(xué)士、碩士和博士學(xué)位授予權(quán)。1988年水文學(xué)及水資源學(xué)科被評(píng)為國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科（該學(xué)科全國(guó)唯一），2002和2007年連續(xù)兩次又被評(píng)為國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科。1993年建成水資源開(kāi)發(fā)利用國(guó)家專(zhuān)業(yè)實(shí)驗(yàn)室，2001年，獲批設(shè)立水資源開(kāi)發(fā)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，2004年獲批為水文水資源與水利工程科學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。2005年獲批建設(shè)水資源高效利用與工程安全國(guó)家工程研究中心。1996、2002和2008年水文學(xué)及水資源學(xué)科分別列入“九五”、“十五”和“十一五”國(guó)家“211工程”重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目。2008年水文學(xué)及水資源學(xué)科創(chuàng)新引智基地入選教育部、國(guó)家外國(guó)專(zhuān)家局“高校學(xué)校學(xué)科創(chuàng)新引智計(jì)劃”(111計(jì)劃)。2008年經(jīng)教育部、財(cái)政部批準(zhǔn)建設(shè)“全球水循環(huán)與國(guó)家水安全”優(yōu)勢(shì)學(xué)科創(chuàng)新平臺(tái)（俗稱(chēng)“小985”）。2010/2017：列入江蘇省高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科創(chuàng)新平臺(tái)。2017年，獲批國(guó)家“雙一流”建設(shè)學(xué)科。

學(xué)院現(xiàn)設(shè)有水文與水資源工程系、水務(wù)工程系；水文預(yù)報(bào)研究所、工程水文及水文氣象研究所、水資源研究所、智慧水文水利研究所、城市水務(wù)工程研究所、地理與資源環(huán)境研究所、干旱研究所、中德水資源研究所；全球變化與水循環(huán)研究中心；河海大學(xué)水問(wèn)題研究所和國(guó)際河流研究所等等。1997年，聯(lián)合國(guó)教科文組織通過(guò)專(zhuān)門(mén)議案，在我校設(shè)立UNESCO國(guó)際水文水資源及環(huán)境培訓(xùn)與研究中心。

學(xué)院現(xiàn)有教職工118人，其中正高38名，副高57名；博士生導(dǎo)師32名，碩士生導(dǎo)師54名。學(xué)院擁有水利工程博士后流動(dòng)站；水文學(xué)及水資源、城市水務(wù)、生態(tài)水利3個(gè)博士學(xué)位授權(quán)二級(jí)學(xué)科，水文學(xué)及水資源、城市水務(wù)、生態(tài)水利3個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)二級(jí)學(xué)科；土木水利碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)類(lèi)別，土木水利、資源與環(huán)境2個(gè)博士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)類(lèi)別；其中，水文學(xué)及水資源、城市水務(wù)、生態(tài)水利學(xué)為國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科；設(shè)有水文與水資源工程、水務(wù)工程2個(gè)本科專(zhuān)業(yè)。學(xué)院建設(shè)的《工程水文學(xué)》《水文統(tǒng)計(jì)》《水資源與現(xiàn)代水利》《水利類(lèi)專(zhuān)業(yè)導(dǎo)論》《走近地下水》等獲得國(guó)家精品開(kāi)放課程稱(chēng)號(hào)，《水信息采集與處理》《地下水水文學(xué)》被評(píng)為國(guó)家雙語(yǔ)教學(xué)示范課程，擁有國(guó)家級(jí)水利工程實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心等國(guó)家本科教學(xué)實(shí)踐平臺(tái)。畢業(yè)生遍布全國(guó)各地，在業(yè)內(nèi)發(fā)揮重要作用，深受社會(huì)歡迎。

多年來(lái)，學(xué)院一直秉承“繼承與發(fā)展”的方針，注重學(xué)術(shù)積累，已逐步形成覆蓋水文、水資源、水環(huán)境及3S技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域比較穩(wěn)定的研究方向，有一支理論基礎(chǔ)深厚、實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)豐富老、中、青相結(jié)合的學(xué)術(shù)帶頭人和學(xué)術(shù)骨干隊(duì)伍，并與國(guó)內(nèi)外水文水資源領(lǐng)域著名的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)建立了良好的合作關(guān)系。學(xué)院緊密跟蹤與引導(dǎo)學(xué)科發(fā)展趨勢(shì)，積極參與解決國(guó)民經(jīng)濟(jì)建設(shè)中的重大水文水資源及環(huán)境問(wèn)題，總體上居國(guó)際先進(jìn)水平。