為了突出“創(chuàng)知、創(chuàng)新、創(chuàng)業(yè)” 的辦學特色， 南科大結(jié)合當前科技創(chuàng)新的新趨勢和對人才培養(yǎng)的新要求，于2016年8月正式設立創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)學院（簡稱“學院”），承擔深圳市綜合性國家科學中心、中國特色社會主義先行示范區(qū)、大灣區(qū)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心等建設任務，服務于國家戰(zhàn)略發(fā)展。學院致力于創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)通識教育、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)基地建設、工程碩士和工程博士培養(yǎng)、CTO培養(yǎng)、企業(yè)家培養(yǎng)、以校企聯(lián)合實驗室為基礎的工業(yè)研究平臺建設，成為鏈接南科大與高科技企業(yè)之間的“橋梁”。

創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)學院現(xiàn)已建立一支以18名教授為核心、42名其他院系和國際名校的教學及研究教授為支撐、482名兼職產(chǎn)業(yè)教授和業(yè)界導師為支持的高水平師資隊伍，力爭實現(xiàn)高水平創(chuàng)新和優(yōu)質(zhì)教育?，F(xiàn)有學院教授中，院士2人，國家級領軍人才1人，原工程研究院負責人、高級研究員3人，原大型企業(yè)技術(shù)總監(jiān)、研究員5人，原海內(nèi)外高校教授3人。機械、材料、數(shù)學、生醫(yī)工、電子、計算機、環(huán)境等院系積極參與產(chǎn)學研轉(zhuǎn)化的教授42人，其中院士2人。目前已聘請482位來自行業(yè)內(nèi)大型企業(yè)、高新技術(shù)企業(yè)、工程類研究院所的高管和專家擔任產(chǎn)業(yè)教授、業(yè)界導師，隊伍將會繼續(xù)穩(wěn)定擴大。

學院志在為國家培養(yǎng)高級應用型人才、企業(yè)領袖及具有優(yōu)秀的創(chuàng)新思維、較高理論水平和突出的解決實際問題能力的創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)高端人才。創(chuàng)院聯(lián)合電子、材料、環(huán)境三個系牽頭成功申請了工程碩士專業(yè)學位點。自2017年起，通過和各院系合作培養(yǎng)的方式，迄今共招收培養(yǎng)988名工程碩士，建立了較為完備、獨具特色的研究生培養(yǎng)模式。畢業(yè)生就業(yè)率高，去向好，首屆畢業(yè)生初次就業(yè)升學率達98.6%，2023屆就業(yè)升學率達100%。創(chuàng)院統(tǒng)籌全校創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)通識教育，為學生提供創(chuàng)業(yè)空間和輔導，并開設《創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大講堂》、《創(chuàng)業(yè)思維與實踐》、《技術(shù)型創(chuàng)業(yè)基礎與實踐》、《產(chǎn)品創(chuàng)新與設計開發(fā)方法》等近20門創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)課程，其中《整合與創(chuàng)新設計》課程作為國際創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)課，助力學校國際化創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育。創(chuàng)院還于2019年攜手法國巴黎HEC商學院共同發(fā)起“iLEAP企業(yè)家培養(yǎng)計劃”，依托南科大強勁的科研實力，融合中外頂級商學院的教育理念，為產(chǎn)業(yè)界培養(yǎng)新一代企業(yè)領袖。

學院還圍繞產(chǎn)學研進行開拓。截至目前，創(chuàng)院已獲批國家級創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)示范基地、深圳市第二批創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)示范基地；建成2個深圳市工程研究中心，包括深圳市低質(zhì)煤綜合利用工程研究中心、深圳無人飛行器設計與導航控制技術(shù)工程研究中心；建成18個校企聯(lián)合實驗室，包括南科大-新宙邦能源材料聯(lián)合實驗室、右力生態(tài)-南科大創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)學院聯(lián)合實驗室等；簽約29個校外實踐教育基地，包括深圳市燃氣集團股份有限公司、深圳市奧比中光科技有限公司、深圳市華大基因?qū)W院、深圳光啟高等理工研究院等；并已籌建清潔能源、航空航天技術(shù)、先進材料等中心實驗平臺。