數(shù)學(xué)系成立于2015年6月，現(xiàn)有基礎(chǔ)數(shù)學(xué)、計算與應(yīng)用數(shù)學(xué)、概率論與金融數(shù)學(xué)三個學(xué)科方向，包含代數(shù)、拓?fù)?、組合數(shù)學(xué)、數(shù)論、代數(shù)幾何、動力系統(tǒng)、偏微分方程、數(shù)學(xué)物理與微分幾何、應(yīng)用數(shù)學(xué)、計算數(shù)學(xué)、概率論、金融數(shù)學(xué)等12個主要研究領(lǐng)域。

數(shù)學(xué)系自成立以來，已初步建成一支國際化的一流師資隊伍，現(xiàn)有教研序列教師41人，均具有海外學(xué)習(xí)或工作經(jīng)歷。其中有1位院士，1人為國際數(shù)學(xué)家大會一小時大會報告人，2人為45分鐘報告人，2位國自然優(yōu)青，7人有四大數(shù)學(xué)頂尖雜志論文，1人獲古根海姆獎，30余人次擔(dān)任國際期刊主編、副主編、編委。

數(shù)學(xué)系志在為國家培養(yǎng)出創(chuàng)新意識高、能力強(qiáng)、有理想的高水平數(shù)學(xué)人才，目前開設(shè)金融數(shù)學(xué)、數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)兩個本科專業(yè)，并已具備數(shù)學(xué)一級學(xué)科碩士、博士學(xué)位授權(quán)點和博士后科研流動站。2019年，數(shù)學(xué)系獲批廣東省重點實驗室一項；2020年，獲批牽頭建設(shè)深圳國家應(yīng)用數(shù)學(xué)中心，這是首批十三個國家應(yīng)用數(shù)學(xué)中心之一，也是深圳首個國家級數(shù)學(xué)中心。2022年2月，數(shù)學(xué)學(xué)科入選第二批“雙一流”建設(shè)學(xué)科名單（全國共15個數(shù)學(xué)學(xué)科入選），數(shù)學(xué)系成為深圳本土第一所“雙一流”學(xué)科建設(shè)單位。