中國音樂學(xué)院指揮系本科教學(xué)秉承學(xué)院“承國學(xué)、揚國韻、育國器、強國音”辦學(xué)理念，以中國傳統(tǒng)文化視角培養(yǎng)指揮人才傳承中華文明、以中國樂派審美觀念培養(yǎng)指揮人才詮釋世界音樂、以世界文化發(fā)展方向培養(yǎng)指揮人才服務(wù)國際需求、以中國精神立足世界培養(yǎng)指揮人才堅守文化自信。在學(xué)院建設(shè)世界一流大學(xué)的辦學(xué)目標(biāo)下，指揮系著力建設(shè)世界一流的指揮學(xué)科，努力構(gòu)建被世界認(rèn)可的中國指揮教學(xué)體系。

指揮系于2003年成立，是中國高等音樂院校高水平指揮人才培養(yǎng)基地。旨在培養(yǎng)能夠在世界音樂舞臺上的專業(yè)文藝團體、專業(yè)藝術(shù)院校、社會文化機構(gòu)等從事音樂表演與教學(xué)研究的指揮專門人才。由李心草教授擔(dān)任學(xué)科帶頭人，指揮系構(gòu)建了國際化一流師資隊伍，其中包括胡詠言（美）、Wolfgang Redik（德）、Alexander Polishchuk（俄）、Peter Stark（英），Guido J Rumstadt（德），Peter Burwik（奧），Viktor Akulovich（俄）構(gòu)成的外教團隊。

指揮系是學(xué)院北京市“一流專業(yè)”建設(shè)項目的實施部門，是學(xué)院“中國樂派”音樂教學(xué)體系的建設(shè)部門。指揮系本科教學(xué)基于學(xué)院發(fā)起并建立的“全球音樂教育聯(lián)盟”，力求課程設(shè)置與培養(yǎng)方案與“聯(lián)盟”成員院校相互認(rèn)可，為世界范圍的音樂人才提供最優(yōu)質(zhì)的指揮教學(xué)資源，搭建最高端的指揮學(xué)習(xí)平臺。

指揮系目前設(shè)置了本科、碩士與博士研究生三個層次的教學(xué)。在研究生階段設(shè)置了歌劇指揮、樂隊指揮、合唱指揮三個專業(yè)方向，目前計劃逐步開設(shè)國樂指揮、早期音樂指揮與流行音樂指揮等專業(yè)研究方向。指揮系本科的培養(yǎng)方案則是圍繞研究生層次所開設(shè)專業(yè)行具有針對性的基礎(chǔ)訓(xùn)練。

指揮系的畢業(yè)生已經(jīng)在國家或省部級藝術(shù)學(xué)院、綜合大學(xué)以及國內(nèi)外專業(yè)藝術(shù)團體擔(dān)任教學(xué)或指揮工作。包括中國音樂學(xué)院、中央音樂學(xué)院、天津音樂學(xué)院、沈陽音樂學(xué)院、北京大學(xué)、清華大學(xué)、國家大劇院、新加坡華樂團、天津交響樂團、哈爾濱交響樂團、甘肅省歌舞劇院、山東省歌舞劇院。另部分本科畢業(yè)生考入國外著名音樂學(xué)院進行深造，包括美國霍普金斯大學(xué)皮博迪音樂學(xué)院、美國辛辛那提大學(xué)音樂學(xué)院、美國曼哈頓音樂學(xué)院、維也納格拉茨音樂藝術(shù)表演大學(xué)、德國紐倫堡音樂學(xué)院等。