學院前身為1983年原大理醫(yī)學院的衛(wèi)生學教研室。2002年招生首屆預防醫(yī)學本科生，2003年與云南省地方病防治所產(chǎn)學研合作共建“預防醫(yī)學系”，2004年更名為“公共衛(wèi)生學院”。

學院設三辦、團委、組織員辦。有7個黨支部，154名黨員（教師黨員31名/學生黨員123名）。設有流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動與環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、衛(wèi)生檢驗與檢疫、食品質(zhì)量與安全5個教研室和1個實驗教學中心。

學院現(xiàn)有公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學（2021年）、公共衛(wèi)生碩士（MPH，2018年）2個一級學科碩士學位授權(quán)點。擁有預防醫(yī)學（醫(yī)學，五年，公衛(wèi)執(zhí)業(yè)醫(yī)師，2002年）、衛(wèi)生檢驗與檢驗（理學，四年，2005年）、食品質(zhì)量與安全（工學，四年，2015年）3個本科專業(yè)。

學院率先與云南省地方病防治所校所合作，與大理大學第六附屬醫(yī)院（昆明市第三人民醫(yī)院）、云南省疾病預防控制中心 “2+2+1”聯(lián)合培養(yǎng)預防醫(yī)學人才，闖出一條產(chǎn)-學-研發(fā)展之路。學院擁有碩士生導師104人（校內(nèi)13人，校外91人），形成了校內(nèi)外聯(lián)合培養(yǎng)的碩士生導師隊伍，為高層次人才可持續(xù)培養(yǎng)奠定基礎。

學院現(xiàn)有教職員工41人，其中專任教師34人（含在讀博士1人），管理人員7人；其中教授5人，副教授（副高級職稱）9人，博士學位的教師13人，云南省“萬人計劃”名醫(yī)1人，云南省中青年學術和技術帶頭人 2 人，云南省衛(wèi)健委醫(yī)學領軍人才1人和醫(yī)學學科帶頭人 2 人以及大理州“蒼洱霞光”人才1人，校級中青年學術帶頭人2人。

學院擁有 “云南省高校重點實驗室”1個、“云南省高校創(chuàng)新團隊”1個、“上海浦東-大理衛(wèi)生發(fā)展研究中心”、“突發(fā)公共衛(wèi)生事件應急處置實驗教學平臺”和“大理大學預防醫(yī)學研究所”等教學科研平臺。擁有“自然疫源性疾病流行病學研究”、“人獸共患病跨境防控及檢疫”、“大理高原植源性食品資源開發(fā)與利用” 3個校級創(chuàng)新團隊。擁有云南省研究生聯(lián)合培養(yǎng)創(chuàng)新基地1個，省級優(yōu)勢特色重點建設學科1個，省級一流本科專業(yè)建設點2個，省級研究生導師團隊1個、省級專業(yè)學位研究生教學案例庫建設項目3項，省級研究生優(yōu)質(zhì)課程2門。

近5年學院獲國家基金項目15項，包括2020年立項資助3項，其中 NSFC-云南聯(lián)合基金重點項目實現(xiàn)了我校國家基金重點項目零的突破。2022年申報國家、教育部級別課題及平臺13項，立項資助3項。

學院以解決長期威脅云南邊疆民族地區(qū)公共衛(wèi)生安全的新發(fā)、再發(fā)和高發(fā)疾病與環(huán)境危害防控為目標，應用基因組學、蛋白質(zhì)組學、微生物組學、分子細胞生物學、生物信息學的交叉融合理論與技術方法，從組織器官、細胞、基因乃至代謝物水平等開展多維度、多尺度研究，形成三個特色優(yōu)勢方向。（1）流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學：針對鼠疫、艾滋病、血吸蟲病和地方病等云南高發(fā)疾病，聚焦疫源地調(diào)查、疾病分布、宿主動物和媒介、防控等方面的研究，明確疾病傳播機制和流行規(guī)律，提升云南傳染病和地方病防控能力和水平，為有效監(jiān)測、防控疾病作出重要貢獻。（2）營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學：圍繞滇西高原食品營養(yǎng)與健康研究，創(chuàng)建地參等植源性食品酚類提取、成分分析、營養(yǎng)活性檢測系列方法，探明其抗氧化、DNA損傷保護、肝損傷保護的作用及機制，有力推進滇西特色資源產(chǎn)品開發(fā)和應用。（3）衛(wèi)生檢驗學：圍繞云南影響重大的病原體、成礦帶重金屬污染健康效應開展研究，以漢坦病毒、冠狀病毒等病毒致病性為研究特色，首次在我國發(fā)現(xiàn)并命名瀘西病毒、福貢病毒和新型戊肝病毒，被國際病毒分類委員會（ICTV）認可和NCBI數(shù)據(jù)庫收錄。

至今為國家招收4438名（本科生3940名，研究生498名），培養(yǎng)了3062名公共衛(wèi)生人才（本科生2781名，研究生281名）。培養(yǎng)的人才80%在云南邊疆民族地區(qū)工作，為云南公共衛(wèi)生安全提供智力支持和人才保障。目前在校生1376名，其中本科生1159名（留學本科生2名），研究生217名（其中學術學位 73名，專業(yè)學位 144名，其中留學生2名）。