魯東大學(xué)農(nóng)林工程研究院（The Engineering Research Institute of Agriculture and Forestry, Ludong University）成立于2021年1月。其前身為魯東大學(xué)農(nóng)林作物遺傳改良中心和山東省十三五高校重點實驗室“作物高產(chǎn)抗逆分子模塊育種實驗室”。研究院由校內(nèi)領(lǐng)軍人才和引進(jìn)人才共同組建，中科院引進(jìn)海外杰出人才“百人計劃”、山東省泰山學(xué)者特聘專家張洪霞教授現(xiàn)任研究院院長。研究院建有2100平米實驗室，1000平米日光溫室和人工氣候室，500平米組織培養(yǎng)室和工廠化苗木脫毒快繁中心，30畝校內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)實驗田和800畝校外示范生產(chǎn)基地，配備激光共聚焦、UPLC分析儀、熒光正置等儀器設(shè)備總額超過1800 萬元，形成了產(chǎn)-學(xué)-研相結(jié)合、上-中-下游為一體的格局和技術(shù)體系，并以合作研究的方式對外開放與共享。

研究院圍繞農(nóng)林作物遺傳改良與應(yīng)用這一目標(biāo)，以應(yīng)用基礎(chǔ)研究為根本，向應(yīng)用開發(fā)和產(chǎn)業(yè)化擴(kuò)展延伸，聚焦科學(xué)前沿，注重理論創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用，從分子水平研究農(nóng)林作物的遺傳性狀和調(diào)控機理，為農(nóng)林作物遺傳改良提供新理論、新技術(shù)，為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供新材料和新方法。以成果轉(zhuǎn)化、服務(wù)地方為基本任務(wù)，對接和滿足企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新需求，提升高端人才在企業(yè)重大項目研發(fā)、科技合作交流中的作用。

聚焦“高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)”和“抗逆”兩項作物的目標(biāo)特性，開展”高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)抗逆植物種質(zhì)資源發(fā)掘和分子模塊解析”，建立現(xiàn)代農(nóng)林產(chǎn)業(yè)育種和技術(shù)體系。研究對象涉及蘋果、梨、葡萄、桃、番茄、辣椒、花卉、中藥材、楊樹、玉米、油菜、大豆等主要農(nóng)林作物。

開展高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)抗逆種質(zhì)資源的篩選與保藏，對已經(jīng)建立的種質(zhì)資源圃、種質(zhì)資源庫進(jìn)行補充、維護(hù)，從中選育核心種質(zhì)資源，進(jìn)行保育、品種篩選工作；利用分子標(biāo)記技術(shù)，對其進(jìn)行全基因組基因型的掃描，為分子模塊解析及組裝和育種奠定基礎(chǔ)。利用分子模塊育種技術(shù)，對所解析的控制植物產(chǎn)量、品質(zhì)和抗性的分子模塊進(jìn)行組裝，進(jìn)行新品種培育。

研究院面向我國農(nóng)業(yè)發(fā)展的重大需求，以應(yīng)用基礎(chǔ)研究為主，向應(yīng)用開發(fā)和產(chǎn)業(yè)鏈擴(kuò)展延伸，方向明確，特色鮮明。目前正在承擔(dān)的科研項目52項，總經(jīng)費2000多萬元。其中承擔(dān)國家自然科學(xué)基金項目、國家科技重大專項和國家重點研發(fā)計劃子課題等國家任務(wù)24項，省部級項目20項，市廳級項目及其他項目11項。在Nat Biotechnol，PNAS，Plant Cell Environ，Cell Res，J Exp Bot，Plant Biotechnol J，Hortic Res，New Phytol等雜志上發(fā)表SCI論文100多篇，授權(quán)專利22項，獲省部級獎勵1項，培育高產(chǎn)、耐逆植物新品系（種）12個。

農(nóng)林工程研究院現(xiàn)有固定人員27人，研究人員23人，技術(shù)人員4人，其中，教授1人，副教授11人。中科院“百人計劃”1人、山東省泰山學(xué)者特聘專家1人、山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)體系創(chuàng)新團(tuán)隊崗位專家1個；山東省青創(chuàng)團(tuán)隊“園藝作物遺傳改良創(chuàng)新團(tuán)隊”1個；魯東大學(xué)農(nóng)林作物遺傳改良中心女博士創(chuàng)新團(tuán)隊1個；獲得全國三八紅旗團(tuán)隊1個。指導(dǎo)學(xué)生參加全國和山東省相關(guān)比賽，獲國家金獎1項、銀獎1項；山東省金獎1項、銀獎1項、二等獎1項。

農(nóng)林工程研究院現(xiàn)有博士生導(dǎo)師2人，碩士生導(dǎo)師23人，其中2位導(dǎo)師培養(yǎng)的研究生獲得國家優(yōu)秀研究生獎。研究院獨立招收園藝學(xué)、農(nóng)藝與種業(yè)、生態(tài)學(xué)、生物學(xué)等碩士研究生，目前在讀碩士研究生共36人。

農(nóng)林工程研究院依托目前“十三五”山東省高等學(xué)校重點實驗室“作物高產(chǎn)抗逆分子模塊育種實驗室”、山東省高等學(xué)校協(xié)同創(chuàng)新中心以及與招遠(yuǎn)市盛慧農(nóng)業(yè)技術(shù)發(fā)展公司共建的“功能型園藝植物高效繁育技術(shù)創(chuàng)新中心”開放（公共）技術(shù)共享平臺，在科學(xué)研究和成果轉(zhuǎn)化等方面同中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院、中國林科院、山東省林科院、南京林業(yè)大學(xué)、東北林業(yè)大學(xué)等各地高校、科研院所和企業(yè)進(jìn)行了深入的實質(zhì)性合作，分別在東營、萊山、招遠(yuǎn)、棲霞等建立了5個開放合作示范基地和工作站。