廈門大學經(jīng)濟研究所1950年創(chuàng)辦。由當時的校長、著名經(jīng)濟學家王亞南倡議和籌劃，經(jīng)教育部批準并直屬教育部，是新中國誕生后在高校中建立的第一所，從1950 年到2010年，已有60年歷史。王亞南校長兼任第一任所長、接任所長先后是胡體乾、袁鎮(zhèn)岳、張來儀、胡培兆、陳其林，現(xiàn)任所長靳濤。曾任副所長的有謝佑權(quán)、葛家澍、羅季榮、錢伯海、鄧子基、鄭普青，胡剛，現(xiàn)任副所長柏培文。首任直屬黨支部書記趙松年，繼任鄭普青、黃山河、徐華，現(xiàn)任書記劉龍政。

建所六十年以來，一直從事馬克思主義經(jīng)濟學、社會主義經(jīng)濟理論與實踐的研究，積累了豐富的學術(shù)成果與經(jīng)驗，形成南方特色優(yōu)勢，具有很強的理論創(chuàng)新能力，特別是在馬克思主義產(chǎn)權(quán)理論、社會主義市場經(jīng)濟理論、產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟理論方面的研究卓有成就，多項研究成果獲國家、教育部、福建省大獎，其中兩項獲“孫冶方經(jīng)濟科學獎”、一項獲“五個一工程”獎。研究人員中有曾任和現(xiàn)任國務(wù)院學位委員會學科評議組成員。國家社科基金項目評審委員、福建省學位委員會委員、教育部社會科學研究專家咨詢委員會委員、教育部鄧小平理論研究中心理事、教育部學風建設(shè)委員會副主任委員、教育部社會科學委員、經(jīng)濟學部召集人等職。

本所師資力量雄厚、學術(shù)梯隊健全，現(xiàn)有教師18人，其中教授5人，副教授5人，助理教授8人。博士生導師6人，具有博士學位 18人。本所設(shè)二級學科博士點 3 個：政治經(jīng)濟學、產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟學、區(qū)域經(jīng)濟學；二級學科碩士點 3 個：政治經(jīng)濟學、產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟學、區(qū)域經(jīng)濟學。他們共同擔負教學、科研、編輯等繁重任務(wù)。僅“十一五”以來承擔國家課題10余項，其中重大、重點課題3項。在所行政、直屬黨支部領(lǐng)導和部門工會組織下，大家愉快工作。這是一個人人忠司職守、孜孜盡責，又能互相激勵幫助、諍友抵牾也不傷感情的好團隊，無愧于王亞南創(chuàng)辦的第一所。由于大家團結(jié)奮斗，在學科建設(shè)、人才培養(yǎng)等方面取得顯著成績。 2000年由本所組織申報經(jīng)濟學一級學科博士學位授予權(quán)點成功， 2001年再由本所牽頭申報政治經(jīng)濟學國家重點學科成功。

研究所成立的當年就招收培養(yǎng)研究生。導師是王亞南、胡體乾、朱保訓、吳兆莘、傅衣凌等著名教授，第一屆（1950 - 1952）研究生是陳可焜、鄧子基、謝佑權(quán)、黃良文、許如奎；第二屆（1951 - 1953）研究生是林克明、胡世凱、劉清漢、潘天順、陳延炮、楊振輝。他們有的早已成為全國著名的經(jīng)濟學家、財政學家、統(tǒng)計學家資深教授?，F(xiàn)在研究生培養(yǎng)規(guī)模和水平大為擴大和提高?，F(xiàn)有政治經(jīng)濟學、產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟學、區(qū)域經(jīng)濟學專業(yè)在讀博士、碩士研究生100多名。其中有臺灣、澳門學生。還為社會辦學培養(yǎng)了幾千名高級專業(yè)人才。

經(jīng)濟研究所主辦的《中國經(jīng)濟問題》也是王亞南校長倡議，經(jīng)試刊一年后由中宣部批準在1959年正式創(chuàng)刊的。同樣是新中國成立后高校中第一家國家級經(jīng)濟學專業(yè)雜志。除校內(nèi)名家外，于光遠、陶大鏞、蔣學模、吳敬璉、周叔蓮、汪海波、衛(wèi)興華、楊堅白等都曾是熱情的作者和支持者?，F(xiàn)由教育部主辦，國內(nèi)外發(fā)行，是CSSCI認證刊物，有些重點大學列為權(quán)威刊物。

對外學術(shù)交流增強、范圍擴大。改革開放以來，全所人員多人次去加拿大、美國、新加坡、韓國、歐盟等國及境外臺灣、香港等地區(qū)的許多著名大學、研究機構(gòu)進行學術(shù)訪問、交流、進修和合作研究等活動。