錦州醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院前身為錦州醫(yī)學(xué)院（現(xiàn)為錦州醫(yī)科大學(xué)）藥學(xué)系，始創(chuàng)于1994年，隨著學(xué)院的發(fā)展，2002年3月更名為藥學(xué)院。

1998年起，招收臨床藥學(xué)方向五年制本科生。2002年至2003年又相繼增招了藥學(xué)專業(yè)四年制本科生和醫(yī)藥經(jīng)貿(mào)專業(yè)四年制本科生。2021年獲批國(guó)控臨床藥學(xué)五年制專業(yè)。現(xiàn)開設(shè)藥學(xué)專業(yè)（四年制本科）、臨床藥學(xué)專業(yè)（五年制本科），具有藥學(xué)專業(yè)和臨床藥學(xué)專業(yè)學(xué)士學(xué)位授予權(quán)。

2001年申報(bào)生藥學(xué)碩士學(xué)位授予權(quán)，2002年開始招收生藥學(xué)碩士研究生。2005年獲批成為藥學(xué)一級(jí)學(xué)科碩士授予權(quán)單位。2010年藥學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位通過(guò)國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)審批，2011年招收藥學(xué)專業(yè)學(xué)位碩士研究生，具有藥學(xué)碩士科學(xué)學(xué)位和專業(yè)學(xué)位授予權(quán)。

藥學(xué)院下設(shè)9個(gè)教研室，擁有遼寧省藥物作用與質(zhì)量評(píng)價(jià)專業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心和遼寧省海洋生物活性物質(zhì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，學(xué)院下設(shè)遼寧省藥學(xué)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心和遼寧省高等院校實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心。學(xué)院現(xiàn)有專任教師68人，其中教授11名，副教授34名，講師17名，助教6名；博士研究生占教師總?cè)藬?shù)51.47%，碩士研究生導(dǎo)師44名，承擔(dān)藥物分析學(xué)、藥劑學(xué)、藥物化學(xué)、生藥學(xué)、微生物與生化藥學(xué)、藥用生物材料學(xué)等學(xué)科碩士研究生的培養(yǎng)任務(wù)。

藥學(xué)院下設(shè)兩個(gè)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心。藥學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心，位于主校區(qū)第三教學(xué)樓，總面積達(dá)1700㎡，中心重視實(shí)驗(yàn)教學(xué)改革，增加綜合性、設(shè)計(jì)性、創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)比例，創(chuàng)建開放性教學(xué)模式，培養(yǎng)學(xué)生實(shí)踐能力及創(chuàng)新水平，全面提升實(shí)驗(yàn)教學(xué)質(zhì)量。

化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心分處主校、西校兩校區(qū)，總面積2000㎡, 共有教學(xué)實(shí)驗(yàn)室12個(gè)，儀器操作室5個(gè)，承擔(dān)多個(gè)層次多個(gè)門類的實(shí)驗(yàn)教學(xué)課程。中心在課程設(shè)置方面著重從培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)新能力入手，以提高學(xué)生實(shí)踐能力和創(chuàng)新意識(shí)為前提，增加綜合性、設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn)比例，創(chuàng)建全新實(shí)驗(yàn)教學(xué)模式，提高實(shí)驗(yàn)教學(xué)效果。

多年來(lái)藥學(xué)院一直堅(jiān)持培養(yǎng)高素質(zhì)藥學(xué)人才的指導(dǎo)方針，堅(jiān)持“以藥為主、醫(yī)藥結(jié)合”的辦學(xué)方向，高度重視“教風(fēng)”和“學(xué)風(fēng)”建設(shè)，堅(jiān)持“以學(xué)生發(fā)展為中心”的辦學(xué)理念，強(qiáng)化學(xué)生綜合實(shí)踐訓(xùn)練能力和創(chuàng)新能力培養(yǎng)，建立了以教師聽課、學(xué)生評(píng)教為核心內(nèi)容的常態(tài)教學(xué)管理和教學(xué)質(zhì)量監(jiān)控。廣大教師愛(ài)崗敬業(yè)，潛心鉆研教學(xué)，不斷提升學(xué)術(shù)與教學(xué)水平；學(xué)院擁有包括科研院所、藥品檢驗(yàn)檢測(cè)中心、藥品生產(chǎn)企業(yè)、醫(yī)院藥學(xué)部、藥品監(jiān)管部門十余家實(shí)訓(xùn)實(shí)習(xí)基地，培養(yǎng)藥品研發(fā)、生產(chǎn)、管理、服務(wù)、監(jiān)測(cè)等方面的應(yīng)用型藥學(xué)專業(yè)人才。學(xué)生系統(tǒng)掌握了藥學(xué)及其相關(guān)學(xué)科的基礎(chǔ)理論和基本技能。一直以來(lái)畢業(yè)生的初次就業(yè)率都在90%以上，從錦州醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院走出的畢業(yè)生受到用人單位的一致好評(píng)。

藥學(xué)院畢業(yè)生考研率逐年升高。部分學(xué)生考取了中科院上海藥物研究所、中國(guó)藥科大學(xué)、沈陽(yáng)藥科大學(xué)、華中科技大學(xué)、天津中醫(yī)藥大學(xué)、哈爾濱醫(yī)科大學(xué)、山西醫(yī)科大學(xué)等知名高校。目前，藥學(xué)院畢業(yè)生分赴北京、上海、天津、重慶、廣州，成都、蘇州、青島、沈陽(yáng)、大連、哈爾濱、鞍山和錦州等全國(guó)大中城市，就業(yè)崗位有藥物研究所藥品研發(fā)研究員、三甲醫(yī)院藥局人員，藥品檢驗(yàn)所實(shí)驗(yàn)技術(shù)員、醫(yī)藥企業(yè)市場(chǎng)部學(xué)術(shù)專員、質(zhì)量部藥品質(zhì)量檢驗(yàn)員、銷售部學(xué)術(shù)推廣員、醫(yī)院藥學(xué)部和藥品管理科技術(shù)員、高校行政人員以及教師和實(shí)驗(yàn)技術(shù)員。如上海藥明康德新藥開發(fā)有限公司研發(fā)員、美國(guó)輝瑞制藥有限公司生產(chǎn)部技術(shù)員、美國(guó)禮來(lái)公司銷售部醫(yī)藥銷售員等崗位，有的畢業(yè)生已走上重要的領(lǐng)導(dǎo)崗位。