學(xué)院的發(fā)展歷史可追溯至我校1980年設(shè)立的高等教育研究室。朱九思、涂又光、姚啟和、蔡克勇、文輔相等老一輩學(xué)者，敢于競爭，善于轉(zhuǎn)化，在期刊建設(shè)、學(xué)科建設(shè)與服務(wù)學(xué)校改革發(fā)展方面奠定了良好基礎(chǔ)，并于1986年和1996年先后獲批高等教育學(xué)碩士點和博士點。2000年始，以成立教育科學(xué)研究院為契機，以新建5100平方米教學(xué)辦公大樓為基礎(chǔ)，在首任院長劉獻君教授的帶領(lǐng)下，學(xué)院各項事業(yè)步入快速發(fā)展期。2003年獲批教育經(jīng)濟與管理博士點，2007年獲批高等教育學(xué)國家重點學(xué)科，2007年獲準(zhǔn)設(shè)立博士后科研流動站，2009年獲批為首批教育博士試點單位，2011年獲批為一級學(xué)科博士點。

目前，學(xué)院下設(shè)高等教育研究所、院校研究所、教育政策與管理研究所、教育學(xué)研究所、心理學(xué)研究所、工程教育研究所以及《高等教育研究》編輯部與《高等工程教育研究》編輯部；獲批有新型教育智庫湖北高等教育研究院以及4個省部級人文社科重點研究基地：院校發(fā)展研究中心、區(qū)域高等教育發(fā)展研究中心、長江經(jīng)濟帶地區(qū)新工科教育研究基地、教育部學(xué)位與研究生教育發(fā)展中心武漢研究基地。同時還設(shè)有創(chuàng)新教育與批判性思維中心、工程教育研究中心等其他校級研究中心。在高等教育學(xué)、教育管理學(xué)、院校研究、工程教育學(xué)、教育學(xué)原理以及教育心理學(xué)6個二級學(xué)科方向招收和培養(yǎng)學(xué)術(shù)型博士，在教育領(lǐng)導(dǎo)與管理、學(xué)生發(fā)展與教育2個領(lǐng)域招收教育博士；在高等教育學(xué)、教育管理學(xué)、院校研究、工程教育學(xué)、教育學(xué)原理、課程與教學(xué)論、教育心理學(xué)7個二級學(xué)科方向招收學(xué)術(shù)型碩士，在教育管理、科學(xué)與技術(shù)教育2個領(lǐng)域招收全日制教育碩士，在教育管理領(lǐng)域招收非全日制教育碩士。

學(xué)院堅持不同于師范大學(xué)發(fā)展教育學(xué)科的道路，注意探索在理工科大學(xué)中發(fā)展教育學(xué)科的經(jīng)驗。在國內(nèi)率先開展大學(xué)文化素質(zhì)教育研究，是教育部大學(xué)生文化素質(zhì)教育指導(dǎo)委員會主任委員和秘書長單位；在國內(nèi)率先倡導(dǎo)開展院校研究，并發(fā)起成立中國高等教育學(xué)會院校研究分會；在國內(nèi)于1986年率先創(chuàng)設(shè)首個高等教育研究交流平臺（全國大學(xué)教育思想研討會）。

展望未來，學(xué)院將借助學(xué)校“雙一流”建設(shè)資源條件，加大人才引進力度，依托中等規(guī)模、團隊化與國際化水平較高的師資隊伍，繼續(xù)堅持突出應(yīng)用性、注重成果轉(zhuǎn)化和社會服務(wù)的發(fā)展思路，兼顧服務(wù)學(xué)校與滿足國家、區(qū)域教育改革發(fā)展重大需求，加快改革人才培養(yǎng)模式和著力提升人才培養(yǎng)質(zhì)量，積極拓展高等工程教育、課程教學(xué)與學(xué)習(xí)科學(xué)研究，力爭優(yōu)勢特色學(xué)科達(dá)到國際一流水平，學(xué)科整體實力達(dá)到國內(nèi)領(lǐng)先水平。（更新于2023年6月30日）