醫(yī)院于1979年籌建，1984年收治病人，1986年正式掛牌開院；福建省腫瘤防治辦公室掛靠醫(yī)院；1997年被國家衛(wèi)生部評為三級甲等腫瘤醫(yī)院；2001年成立福建省腫瘤研究所，與醫(yī)院合署辦公。2013年被列為腫瘤科國家臨床重點(diǎn)專科建設(shè)單位，2016年成為福建醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院，2017年被確認(rèn)為福建省高水平癌癥醫(yī)學(xué)中心建設(shè)單位，2020年被列為爭創(chuàng)國家腫瘤區(qū)域醫(yī)療中心建設(shè)單位，2021年腫瘤放療科獲批國家臨床重點(diǎn)專科建設(shè)項(xiàng)目，2022年成為福建醫(yī)科大學(xué)腫瘤臨床醫(yī)學(xué)院，2023年病理科獲批國家臨床重點(diǎn)專科建設(shè)項(xiàng)目。復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院福建醫(yī)院于2023年正式獲批國家區(qū)域醫(yī)療中心建設(shè)項(xiàng)目，開啟兩個院區(qū)建設(shè)的新征程。

醫(yī)院編制床位1600張，年收治腫瘤病人11.5萬余人次，設(shè)有37個臨床科室、28個病區(qū)、11個醫(yī)技科室和14個腫瘤相關(guān)專業(yè)研究室?，F(xiàn)有職工2512人，專業(yè)技術(shù)人員2211人，其中高級職稱443人，研究生導(dǎo)師105人。醫(yī)院高層次人才匯集，擁有國家級百千萬人才、國家衛(wèi)生健康突出貢獻(xiàn)中青年專家、國務(wù)院特殊津貼專家、省優(yōu)秀人才、省衛(wèi)生健康突出貢獻(xiàn)中青年專家等一批醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才，分別擔(dān)任國家級學(xué)會、協(xié)會及其?？品謺u(yù)主任委員、副主任委員、常委等近50人次。

醫(yī)院作為承擔(dān)福建腫瘤防治與研究的重要平臺，形成腫瘤領(lǐng)域的學(xué)科高地、技術(shù)高地、人才高地、創(chuàng)新高地、運(yùn)行高地和服務(wù)高地，在腫瘤防控和綜合診療方面形成特色優(yōu)勢，在全省及周邊地區(qū)的腫瘤防治工作中發(fā)揮著龍頭作用。腫瘤放射治療科、中西醫(yī)結(jié)合科、普外科（腫瘤）、婦科（腫瘤）、病理科、消化內(nèi)科（腫瘤）、胸外科（腫瘤）、呼吸內(nèi)科（腫瘤）、臨床護(hù)理（腫瘤）為國家和省級臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目。目前已形成集國家臨床重點(diǎn)?？?、國家藥物臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)，福建省腫瘤轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、福建省腫瘤生物治療重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、福建省腫瘤早篩早診前沿技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、福建省腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新研究院、福建省腫瘤精準(zhǔn)診斷與免疫治療工程研究中心、福建省腫瘤放射與免疫治療臨床醫(yī)學(xué)研究中心、福建省肝膽胰腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心、福建省婦科惡性腫瘤精準(zhǔn)治療臨床醫(yī)學(xué)研究中心和福建省消化、呼吸與泌尿生殖系統(tǒng)惡性腫瘤放射與治療臨床醫(yī)學(xué)研究中心、腫瘤大數(shù)據(jù)中心等為一體的腫瘤防治與研究的重要平臺。

復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院福建醫(yī)院依托福建省腫瘤醫(yī)院，平移復(fù)旦腫瘤醫(yī)院先進(jìn)技術(shù)和管理模式，共同建設(shè)國家腫瘤區(qū)域醫(yī)療中心項(xiàng)目。復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院和福建省腫瘤醫(yī)院融合發(fā)展，重新構(gòu)建理念融合、學(xué)科融合、技術(shù)融合、隊(duì)伍融合、管理融合、服務(wù)融合和文化融合的高水平、高質(zhì)量新體系。

針對福建省高發(fā)癌種，依托復(fù)旦腫瘤醫(yī)院在單病種綜合診療上的學(xué)科領(lǐng)先優(yōu)勢，福建醫(yī)院以提升5年生存率和生存質(zhì)量為目標(biāo)，通過優(yōu)化資源配置，以常見和疑難復(fù)雜腫瘤為重點(diǎn)，深化學(xué)科群建設(shè)，形成比較優(yōu)勢。聚焦乳腺癌、肝膽腫瘤、胰腺腫瘤、大腸癌、鼻咽癌、婦科腫瘤等單病種多學(xué)科綜合診療新體系的構(gòu)建，打破學(xué)科壁壘，打造以優(yōu)勢學(xué)科為主體，相關(guān)學(xué)科共同參與的“1+N”學(xué)科群，并在學(xué)科群基礎(chǔ)上成立肝膽胰腫瘤診治中心、鼻咽癌診治中心、婦科腫瘤診治中心、乳腺腫瘤診治中心、大腸癌診治中心等五大診治中心，形成福建省高發(fā)癌種診治新能力和國家腫瘤區(qū)域醫(yī)療中心建設(shè)新特色，讓群眾在福建就能享受到優(yōu)質(zhì)醫(yī)療服務(wù)，改變長途奔波就醫(yī)現(xiàn)狀。

醫(yī)院堅(jiān)持黨建引領(lǐng)保障，深化文明創(chuàng)建，秉持“團(tuán)結(jié)嚴(yán)謹(jǐn)敬業(yè)奉獻(xiàn)”的院訓(xùn)，形成精神文明與業(yè)務(wù)工作交匯融合、雙向提升的良好局面，連續(xù)蟬聯(lián)四屆全國文明單位，先后獲得中國百佳最具影響力腫瘤醫(yī)療機(jī)構(gòu)、全國醫(yī)院醫(yī)保管理先進(jìn)單位、全國模范職工之家、全國科教文衛(wèi)體系統(tǒng)先進(jìn)工會組織、全國公共機(jī)構(gòu)能效領(lǐng)跑者、全國節(jié)約型公共機(jī)構(gòu)示范單位、人文醫(yī)院文化建設(shè)典型、福建省衛(wèi)生健康系統(tǒng)先進(jìn)集體等榮譽(yù)稱號；先后獲得南丁格爾獎、全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)工作者、全國優(yōu)秀科技工作者、全國醫(yī)德標(biāo)兵、全國創(chuàng)先爭優(yōu)先進(jìn)女職工、全國優(yōu)秀工會工作者、全國巾幗文明崗、全國巾幗建功標(biāo)兵等國家級榮譽(yù)40余人次。