福建醫(yī)科大學臨床醫(yī)學部，前身為臨床教學部，2016年1月更名為臨床醫(yī)學部，主要負責我校非直屬附屬醫(yī)院和教學醫(yī)院四、五年級臨床醫(yī)學專業(yè)（含麻醉學）本科生，以及臨床醫(yī)學類研究生的學生管理與教學管理工作。學部下設(shè)黨政管理辦公室、教學科研辦公室、研究生教育科和學生工作辦公室（分團委）4個科級機構(gòu)。

學部現(xiàn)有在校生2057人，其中本科生929人，研究生1128人，分布在近30家培養(yǎng)單位，其中非直屬附屬醫(yī)院11家；學部黨委同時還負責省立臨床醫(yī)學院等4家臨床醫(yī)學院學生黨建工作，共有學生黨支部30個，黨員數(shù)685名。

學部現(xiàn)有教研室成員4500多名，研究生導師580余人，其中博士研究生導師近20人。學部立足福建，面向全國，秉承“勤奮、嚴謹、求實、創(chuàng)新”的校訓，致力于強化臨床教學過程管理、提高教育教學質(zhì)量，為培養(yǎng)優(yōu)秀醫(yī)學人才不懈努力。