工程研究院是安徽工業(yè)大學(xué)直屬單位。2011年3月，根據(jù)校黨委會(huì)議決定以及人〔2011〕9號(hào)文件要求，學(xué)校撤銷原工程研究中心，成立工程研究院。

工程研究院現(xiàn)有教育部冶金減排與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、現(xiàn)代表界面工程研究中心以及現(xiàn)代分析測試中心3個(gè)內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)，下設(shè)綜合管理部、項(xiàng)目開發(fā)與管理部及重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室管理辦公室職能科室3個(gè)。研究院現(xiàn)有專職教工53人（含外教1人），其中正高7人，副高21人，博士33人，博士占比為63.4%。

工程研究院作為安徽工業(yè)大學(xué)科學(xué)研究與服務(wù)社會(huì)的綜合平臺(tái)，主要功能是依托學(xué)校學(xué)科優(yōu)勢，整合校內(nèi)外優(yōu)質(zhì)科研資源，緊扣國家發(fā)展戰(zhàn)略及地方經(jīng)濟(jì)與社會(huì)發(fā)展的需求，構(gòu)建科研組織與平臺(tái)，建設(shè)高水平研發(fā)團(tuán)隊(duì)，開展科學(xué)研究與技術(shù)創(chuàng)新，促進(jìn)科研成果產(chǎn)業(yè)化，為社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展做出貢獻(xiàn)，同時(shí)支撐、推進(jìn)學(xué)校學(xué)科建設(shè)與發(fā)展。工程研究院的建設(shè)與發(fā)展，對于加快學(xué)校內(nèi)涵發(fā)展，提高學(xué)校科學(xué)研究與服務(wù)社會(huì)能力，加快社會(huì)創(chuàng)新體系建設(shè)具有重要意義。

工程研究院依據(jù)功能定位，以“五個(gè)平臺(tái)”建設(shè)與運(yùn)行為主要任務(wù)。

（1）科學(xué)研究平臺(tái)。根據(jù)學(xué)校學(xué)科發(fā)展與科研需求，建設(shè)科學(xué)研究平臺(tái)與高水平研發(fā)團(tuán)隊(duì)；依托學(xué)校、政府與企業(yè)，以服務(wù)產(chǎn)業(yè)為目標(biāo)，構(gòu)建產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院。

（2）技術(shù)創(chuàng)新平臺(tái)。建設(shè)以服務(wù)行業(yè)為目標(biāo)的創(chuàng)新研究平臺(tái)，開展產(chǎn)學(xué)研合作，不斷拓展社會(huì)服務(wù)領(lǐng)域和范圍。

（3）設(shè)備共享平臺(tái)。建設(shè)高水平公共分析測試平臺(tái)，促進(jìn)大型儀器資源共享，為學(xué)校教學(xué)、科研服務(wù)，同時(shí)為社會(huì)提供高質(zhì)量分析測試服務(wù)。

（4）成果轉(zhuǎn)化平臺(tái)。建設(shè)集科研成果鑒定、發(fā)布與中介服務(wù)為一體的綜合性成果轉(zhuǎn)化平臺(tái)，通過合作、授權(quán)、轉(zhuǎn)讓、入股、創(chuàng)辦企業(yè)等形式，促進(jìn)科技成果轉(zhuǎn)化。

（5）人才培養(yǎng)平臺(tái)。利用科研平臺(tái)和科研項(xiàng)目，通過研究生培養(yǎng)，為社會(huì)輸送高層次工程技術(shù)人才。通過項(xiàng)目合作形式，為行業(yè)和地方企業(yè)培養(yǎng)應(yīng)用人才。

目前，工程研究院負(fù)責(zé)安徽工業(yè)大學(xué)科技園有限公司、安徽工業(yè)大學(xué)信息技術(shù)研究院（公司）、安徽工業(yè)大學(xué)宣城工業(yè)技術(shù)研究院（公司）、安徽工業(yè)大學(xué)和縣化工產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究院（公司）、安徽工業(yè)大學(xué)智能裝備技術(shù)研究院（公司）以及安徽工業(yè)大學(xué)蕪湖技術(shù)創(chuàng)新研究院的運(yùn)營與管理。