上海大學(xué)材料基因組工程研究院起步于2012年初。近年來在中國工程院前院長徐匡迪院士的鼓勵和推動下，上海大學(xué)的材料基因組研究學(xué)術(shù)氣氛濃厚，研究交流活躍，曾先后于2012年5月舉辦了國內(nèi)首個“材料基因組工程”專題學(xué)術(shù)論壇，徐匡迪院士、王崇愚院士、崔俊芝院士等會來自國內(nèi)外的近二十余名專家出席了本次學(xué)術(shù)論壇并作學(xué)術(shù)報告，同年獲得市教委“085”專項高額經(jīng)費支持啟動了“材料基因工程”研究。2014年4月，由中國硅酸鹽學(xué)會，中國工程院化工、冶金與材料工程學(xué)部，上海大學(xué)共同主辦的第六屆無機材料專題——材料基因組工程研究進展研討會在上海大學(xué)召開。幾年來，上海大學(xué)材料基因組研究秉承“學(xué)科高度融合、數(shù)據(jù)與計算集成、研究與應(yīng)用結(jié)合”等材料加速研發(fā)理念，在科學(xué)研究、團隊建設(shè)、平臺構(gòu)架和人才培養(yǎng)方面有了長足的積累，在數(shù)據(jù)庫建設(shè)、集成計算與軟件開發(fā)、結(jié)構(gòu)與物性表征、服役與失效等基地建設(shè)方面進行了大量基礎(chǔ)性工作。

2014年7月張統(tǒng)一院士加盟上海大學(xué)被聘為研究院院長，徐匡迪院士任名譽院長，研究院正式成立。研究院下設(shè)計算材料科學(xué)中心、材料科學(xué)數(shù)據(jù)庫中心、材料表征科學(xué)與技術(shù)研究所、智能材料及應(yīng)用技術(shù)研究所、先進能源材料研究開發(fā)中心等單位。目前研究院擁有中國科學(xué)院和中國工程院院士6名（含兼職4名）、973首席科學(xué)家1名、以及國家杰出青年基金獲得者4名在內(nèi)的50余名專家學(xué)者組成的研究團隊。在結(jié)構(gòu)材料、能源材料、智能與功能材料等若干研究方向形成了有特色的研究基地，承擔國家973、863、國家自然科學(xué)基金重點和面上等科技計劃50余項。并在上海市政府領(lǐng)導(dǎo)下，作為牽頭單位協(xié)同復(fù)旦大學(xué)、華東理工大學(xué)、上海交通大學(xué)、上海材料研究所、中科院上海硅酸鹽研究所、中科院上海應(yīng)用物理研究所（上海光源）等單位承擔著“上海材料基因組工程研究院”的建設(shè)。在高層次人才培養(yǎng)方面，按照國際化標準對接材料科學(xué)前沿原始創(chuàng)新和先進制造業(yè)的應(yīng)用需求。