上海大學材料基因組工程研究院起步于2012年初。近年來在中國工程院前院長徐匡迪院士的鼓勵和推動下，上海大學的材料基因組研究學術氣氛濃厚，研究交流活躍，曾先后于2012年5月舉辦了國內首個“材料基因組工程”專題學術論壇，徐匡迪院士、王崇愚院士、崔俊芝院士等會來自國內外的近二十余名專家出席了本次學術論壇并作學術報告，同年獲得市教委“085”專項高額經(jīng)費支持啟動了“材料基因工程”研究。2014年4月，由中國硅酸鹽學會，中國工程院化工、冶金與材料工程學部，上海大學共同主辦的第六屆無機材料專題——材料基因組工程研究進展研討會在上海大學召開。幾年來，上海大學材料基因組研究秉承“學科高度融合、數(shù)據(jù)與計算集成、研究與應用結合”等材料加速研發(fā)理念，在科學研究、團隊建設、平臺構架和人才培養(yǎng)方面有了長足的積累，在數(shù)據(jù)庫建設、集成計算與軟件開發(fā)、結構與物性表征、服役與失效等基地建設方面進行了大量基礎性工作。

2014年7月張統(tǒng)一院士加盟上海大學被聘為研究院院長，徐匡迪院士任名譽院長，研究院正式成立。研究院下設計算材料科學中心、材料科學數(shù)據(jù)庫中心、材料表征科學與技術研究所、智能材料及應用技術研究所、先進能源材料研究開發(fā)中心等單位。目前研究院擁有中國科學院和中國工程院院士6名（含兼職4名）、973首席科學家1名、以及國家杰出青年基金獲得者4名在內的50余名專家學者組成的研究團隊。在結構材料、能源材料、智能與功能材料等若干研究方向形成了有特色的研究基地，承擔國家973、863、國家自然科學基金重點和面上等科技計劃50余項。并在上海市政府領導下，作為牽頭單位協(xié)同復旦大學、華東理工大學、上海交通大學、上海材料研究所、中科院上海硅酸鹽研究所、中科院上海應用物理研究所（上海光源）等單位承擔著“上海材料基因組工程研究院”的建設。在高層次人才培養(yǎng)方面，按照國際化標準對接材料科學前沿原始創(chuàng)新和先進制造業(yè)的應用需求。