廈門大學藥學院于2010年，在廈門大學生物醫(yī)學研究院（2006年）、醫(yī)學院藥學系（2004年）的基礎上成立，集聚學校生物醫(yī)藥領域的高水平研究人才。

學院緊密結合健康中國戰(zhàn)略和創(chuàng)新藥物發(fā)展戰(zhàn)略的重要需求，服務福建省及臺海區(qū)域生物醫(yī)藥產業(yè)升級和戰(zhàn)略轉型需要，樹立“原創(chuàng)發(fā)現(xiàn)、靶向特色、轉化導向、學科高度交叉融合和平衡發(fā)展”的建設宗旨，以創(chuàng)新藥物研發(fā)和現(xiàn)代藥學高端人才培養(yǎng)為目標，專注“源頭創(chuàng)新”核心特色，建設一流藥學學科。廈大藥理學和毒理學在2018年進入ESI前1%，藥學學科位列泰晤士2021年高等教育中國學科評級A等級、2023軟科中國大學本科專業(yè)排名A等級，藥學學科在2022年入選國家級一流本科專業(yè)建設點。

學院具有多年本科、研究生教育培養(yǎng)經驗，實施藥學創(chuàng)新人才培養(yǎng)，輸送高素質綜合性人才?，F(xiàn)有藥學本科專業(yè)、藥學第二學士學位專業(yè)、藥學一級學科博士學位授權點、藥學碩士專業(yè)學位授權點。招收藥學專業(yè)本科生，藥學學術型博士研究生，藥理學、藥物化學、藥劑學、藥物分析學學術型碩士研究生，藥學專業(yè)學位碩士研究生。學院設立豐厚的本科、研究生獎學金，為碩士研究生提供全額學費。截至2023年9月，共有本科生290人，碩士研究生277人，博士研究生75人。獲批國家級一流本科課程《天然藥物化學》，建有福建省藥學人才培養(yǎng)創(chuàng)新實驗區(qū)，福建省藥學實驗教學示范中心，福建省藥學虛擬仿真實驗教學中心。畢業(yè)生廣泛進入高校及醫(yī)藥研究單位、醫(yī)藥監(jiān)管部門、醫(yī)院及醫(yī)療衛(wèi)生系統(tǒng)等單位和行業(yè)。

學院延攬高層次人才，培育中青年骨干，打造一流師資隊伍。截至2023年9月，共有教職工75人（其中專任教師49人），博士后10人。專任教師有教授18人，副教授21人，其中博士生導師24人。專任教師隊伍呈現(xiàn)高層次、年輕化、國際化的特點，為提升教育教學和科技創(chuàng)新水平提供有力支撐。有8人獲國家級人才項目和稱號，100%具有博士學歷，七成以上具海外學術經歷，五成為博士生導師，七成教師年齡不超過45歲。建有教育部“核受體腫瘤分子靶點與藥物開發(fā)”創(chuàng)新團隊、福建省高等學?！熬珳仕幬锇悬c發(fā)現(xiàn)與藥物篩選”科技創(chuàng)新團隊。

學院專注源頭創(chuàng)新科研，瞄準國際學術前沿，重點聚焦癌癥、艾滋病、代謝性疾病、皮膚和免疫性疾病等重大疾病的分子機理，開展新靶點的鑒定，先導藥物的發(fā)現(xiàn)和改造，以及轉化研究等，產出了一批具有鮮明自主創(chuàng)新特色的科研成果。教師在Nature、Cell及CNS子刊等高水平期刊發(fā)表百余篇學術論文，立項有國家重點研發(fā)計劃、863課題、973課題、國家基金重大研究計劃項目、“重大新藥創(chuàng)制”國家科技重大專項、國家國際科技合作專項、教育部科技研究重大項目等重要課題，研發(fā)的藥物、治療方法、診斷試劑等轉化應用于臨床，2個創(chuàng)新靶點藥物申請美國FDA臨床批件，其中1項已進入臨床I期試驗階段。

學院圍繞創(chuàng)新特色體系，構建多層次的教學、科研平臺，基本建立了從原創(chuàng)核受體靶點發(fā)現(xiàn)、關鍵技術開發(fā)到創(chuàng)新藥物轉化的全鏈條研發(fā)、服務和人才培養(yǎng)體系?，F(xiàn)有南方海洋創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺（國家海洋局），海洋活性物質功能、質量和安全性評價技術平臺（國家海洋局-廈門市），福建省藥物新靶點研究重點實驗室，福建省核受體藥物工程研究中心，福建省靶點新藥行業(yè)技術開發(fā)基地等，參與建設國家重大新藥創(chuàng)制科技重大專項示范性藥物臨床評價技術平臺“抗腫瘤新藥臨床評價技術示范性平臺”等國家級平臺。并建設有廈門市代謝性疾病重點實驗室、廈門市靶點新藥工程技術研究中心、廈門市藥用植物開發(fā)中試公共服務平臺、廈門生物醫(yī)藥協(xié)同創(chuàng)新中心（技術支撐）、廈門化學創(chuàng)新藥研發(fā)重大平臺（技術支撐）。與地方政府、醫(yī)藥企業(yè)、科研院所開展產學研合作，聯(lián)合共建校外教學實習實踐基地、院企研發(fā)中心、成果轉化中心和技術服務中心。此外還建有高通量藥物篩選平臺和儀器分析測試中心，對外開展公共服務。

學院與國內外科研院校、大型醫(yī)藥企業(yè)和地方政府緊密聯(lián)系，開展多層次合作。學院與美國桑福德-伯納姆-普利貝斯醫(yī)學研究所（Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute）、新加坡分子與細胞生物學研究院（Institute of Molecular and Cell Biology, Singapore）、美國辛辛那提大學藥學院（College of Pharmacy, University of Cincinnati）、美國加州大學圣地亞哥分校和伯克利分校（University of California, San Diego, Berkeley）、臺北醫(yī)學大學藥學院等境外院校開展密切的教學、科研合作與交流，輸送學生出國長期或短期留學、交流，聯(lián)合培養(yǎng)國際型拔尖人才。

學院位于廈門大學翔安校區(qū)，建有一萬五千平方米的藥學院大樓，配備國際水準的尖端儀器設備和高等級實驗室，綜合辦學條件優(yōu)越，能夠滿足本、碩、博多層次的教學和科研需求。學院自信自強、守正創(chuàng)新，對標一流、踔厲奮進，加快建設為特色鮮明的高水平研究型藥學院。