廈門大學(xué)建筑與土木工程學(xué)院的辦學(xué)歷史可以追溯到1922年7月學(xué)校增設(shè)的工學(xué)部，1923年4月，工學(xué)部改為工科，1924年6月，工科歸并到理科，下設(shè)工程學(xué)系，土木工程教授田淵添任物理學(xué)系主任兼工程學(xué)系主任。1926年8月，工程學(xué)系獨(dú)立為工科，下設(shè)土木工程系、電氣工程系、機(jī)械工程系。1927年6月，工科停辦。1937年秋，在國(guó)家危亡、中華民族全面抗戰(zhàn)的艱難歲月里，時(shí)任校長(zhǎng)薩本棟堅(jiān)持讓學(xué)校在戰(zhàn)火中發(fā)展，考慮到戰(zhàn)后國(guó)家急需建設(shè)人才，毅然決定增設(shè)土木工程系，并短期親自兼任土木工程系主任，為國(guó)家和社會(huì)培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的土木工程人才。1953年，由于全國(guó)范圍院系調(diào)整，土木工程系再次停辦,相關(guān)師生調(diào)整到浙江大學(xué)、南京工學(xué)院（現(xiàn)東南大學(xué)）、同濟(jì)大學(xué)、華東水利學(xué)院（現(xiàn)河海大學(xué)）等兄弟院校。1987年，在東南大學(xué)協(xié)助下創(chuàng)辦建筑系，1999年復(fù)辦土木工程專業(yè)，2004年成立建筑與土木工程學(xué)院，2007年成立城市規(guī)劃系。

土木工程系辦學(xué)歷史可以追溯到1922年7月學(xué)校增設(shè)的工學(xué)部，1923年4月，工學(xué)部改為工科，1924年6月，工科歸并到理科，下設(shè)工程學(xué)系，土木工程教授田淵添任物理學(xué)系主任兼工程學(xué)系主任。1926年8月，工程學(xué)系獨(dú)立為工科，下設(shè)土木工程系、電氣工程系、機(jī)械工程系。1927年6月，工科停辦。1937年秋，在國(guó)家危亡、中華民族全面抗戰(zhàn)的艱難歲月里，時(shí)任校長(zhǎng)薩本棟堅(jiān)持讓學(xué)校在戰(zhàn)火中發(fā)展，考慮到戰(zhàn)后國(guó)家急需建設(shè)人才，毅然決定增設(shè)土木工程系，并短期親自兼任土木工程系主任，為國(guó)家和社會(huì)培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的土木工程人才。如我國(guó)著名巖土工程專家、1943屆校友曾國(guó)熙教授，隨機(jī)結(jié)構(gòu)動(dòng)力學(xué)國(guó)際著名學(xué)者、美國(guó)工程院院士、1946屆校友林幼堃先生，中國(guó)工程勘察設(shè)計(jì)大師、1947屆校友吳自迪先生等。1953年由于全國(guó)院校大調(diào)整，廈門大學(xué)土木工程系內(nèi)遷到浙江大學(xué)、南京工學(xué)院（現(xiàn)東南大學(xué)）、同濟(jì)大學(xué)、華東水利學(xué)院（現(xiàn)河海大學(xué)）等兄弟院校。1999年學(xué)校申請(qǐng)并經(jīng)教育部批準(zhǔn)，恢復(fù)了該土木工程專業(yè)，2003年獲“結(jié)構(gòu)工程”碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，2004年復(fù)辦土木工程系，2005年獲得“土木工程”“力學(xué)”兩個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授予權(quán)并獲得“建筑與土木工程”工程碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。2014年申請(qǐng)并通過(guò)了住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部高等教育土木工程專業(yè)評(píng)估，2018年土木工程專業(yè)通過(guò)了全國(guó)工程教育認(rèn)證。