廈門大學(xué)建筑與土木工程學(xué)院的辦學(xué)歷史可以追溯到1922年7月學(xué)校增設(shè)的工學(xué)部，1923年4月，工學(xué)部改為工科，1924年6月，工科歸并到理科，下設(shè)工程學(xué)系，土木工程教授田淵添任物理學(xué)系主任兼工程學(xué)系主任。1926年8月，工程學(xué)系獨(dú)立為工科，下設(shè)土木工程系、電氣工程系、機(jī)械工程系。1927年6月，工科停辦。1937年秋，在國家危亡、中華民族全面抗戰(zhàn)的艱難歲月里，時任校長薩本棟堅(jiān)持讓學(xué)校在戰(zhàn)火中發(fā)展，考慮到戰(zhàn)后國家急需建設(shè)人才，毅然決定增設(shè)土木工程系，并短期親自兼任土木工程系主任，為國家和社會培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的土木工程人才。1953年，由于全國范圍院系調(diào)整，土木工程系再次停辦,相關(guān)師生調(diào)整到浙江大學(xué)、南京工學(xué)院（現(xiàn)東南大學(xué)）、同濟(jì)大學(xué)、華東水利學(xué)院（現(xiàn)河海大學(xué)）等兄弟院校。1987年，在東南大學(xué)協(xié)助下創(chuàng)辦建筑系，1999年復(fù)辦土木工程專業(yè)，2004年成立建筑與土木工程學(xué)院，2007年成立城市規(guī)劃系。

城市規(guī)劃系是從國家海西發(fā)展戰(zhàn)略的實(shí)際需要出發(fā)，以堅(jiān)實(shí)的建筑學(xué)科為基礎(chǔ)，結(jié)合廈門大學(xué)在海洋、環(huán)境、經(jīng)濟(jì)、社會、人文等學(xué)科優(yōu)勢，由校長聘請國內(nèi)著名的城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)者馬武定教授擔(dān)任首任系主任，于2007年正式創(chuàng)辦。現(xiàn)設(shè)有城鄉(xiāng)規(guī)劃本科專業(yè)和城市與區(qū)域規(guī)劃二級學(xué)科碩士點(diǎn)。城市規(guī)劃系成立以來，在教學(xué)、科研、實(shí)踐等方面發(fā)展迅速，畢業(yè)生的深造或就業(yè)情況均較為理想。2017年通過了住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部高等教育城鄉(xiāng)規(guī)劃專業(yè)本科教育評估，2021年通過專業(yè)教育評估復(fù)評。