廈門大學建筑與土木工程學院的辦學歷史可以追溯到1922年7月學校增設的工學部，1923年4月，工學部改為工科，1924年6月，工科歸并到理科，下設工程學系，土木工程教授田淵添任物理學系主任兼工程學系主任。1926年8月，工程學系獨立為工科，下設土木工程系、電氣工程系、機械工程系。1927年6月，工科停辦。1937年秋，在國家危亡、中華民族全面抗戰(zhàn)的艱難歲月里，時任校長薩本棟堅持讓學校在戰(zhàn)火中發(fā)展，考慮到戰(zhàn)后國家急需建設人才，毅然決定增設土木工程系，并短期親自兼任土木工程系主任，為國家和社會培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的土木工程人才。1953年，由于全國范圍院系調整，土木工程系再次停辦,相關師生調整到浙江大學、南京工學院（現(xiàn)東南大學）、同濟大學、華東水利學院（現(xiàn)河海大學）等兄弟院校。1987年，在東南大學協(xié)助下創(chuàng)辦建筑系，1999年復辦土木工程專業(yè)，2004年成立建筑與土木工程學院，2007年成立城市規(guī)劃系。

學院現(xiàn)設有建筑系、土木工程系、城市規(guī)劃系。擁有建筑學、土木工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃3個本科專業(yè)，設有建筑學（含城市規(guī)劃）、土木工程2個一級學科碩士點及建筑學、土木水利（含土木工程和海洋工程2個專業(yè)領域）碩士專業(yè)學位授權點,建筑學一級學科博士點，自主設置“建筑環(huán)境監(jiān)測及防護”二級學科博士點。

建筑學、土木工程專業(yè)為國家級一流本科專業(yè)建設點，建筑學專業(yè)入選教育部第三批“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”。城鄉(xiāng)規(guī)劃專業(yè)為福建省省級一流本科專業(yè)建設點。

建筑學、土木工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃專業(yè)均通過了國家住建部評估委專業(yè)教育評估（認證），其中建筑學專業(yè)被評為“優(yōu)秀”。

建筑學、土木工程學科為福建省重點學科，擁有福建省濱海土木工程數(shù)字仿真重點實驗室、福建省智慧城市感知與計算重點實驗室（與信息學院聯(lián)合申請設立）、閩臺非遺文化數(shù)字化保護與智能處理文化和旅游部重點實驗室（與信息學院聯(lián)合申請設立）、智慧低碳建筑技術福建省高校重點實驗室、廈門市交通基礎設施智能管養(yǎng)工程技術研究中心、廈門市建筑遺產保護智能技術集成應用重點實驗室等重要科研平臺，獲批福建省土木工程實驗教學示范中心、福建省BIM虛擬仿真實驗教學中心等省級教學實驗中心。

建筑系于1987年在廈門大學蔡啟瑞院士關心倡議下由東南大學建筑系協(xié)助創(chuàng)辦，東南大學派遣了郭湖生、盧志昌兩位教授來系主持工作。1990年代以來步入快速發(fā)展時期。1999年獲“建筑設計及其理論”碩士學位授權點，2003年通過了“全國高等學校建筑學專業(yè)教育評估”，獲得“建筑學學士”專業(yè)學位授予權。2005年獲得“建筑學”一級學科碩士學位授予權 。2007年通過了“全國高等學校建筑學專業(yè)教育評估”復評，申請并通過了“全國高等學校建筑學碩士學位研究生教育評估，獲得了“建筑學碩士”專業(yè)學位授予權。2011年和2015年通過專業(yè)教育評估復評，2019年復評被評為“優(yōu)秀”。