2000年，在中國工程院院士沈寅初倡議下，浙江工業(yè)大學藥學院開始組建，并于2001年11月28日正式掛牌成立。2013年，依托學院為主體申報的“長三角綠色制藥協(xié)同創(chuàng)新中心”入選首批國家“2011計劃”。

學院秉承“天人合一，循理精煉”的院訓，全面落實立德樹人根本任務，努力為國家和區(qū)域醫(yī)藥健康產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展提供堅實的人才和科技支撐?，F(xiàn)有教職工151人，其中專任教師123人（正高級職稱教師32人、副高級職稱教師48人、具有博士學位教師116人）。擁有藥學一級學科博士后科研流動站、藥學一級學科博士點、藥學一級學科碩士點，藥學、中藥學、生物與醫(yī)藥（制藥工程）等3個碩士專業(yè)學位授權(quán)類別，以及制藥工程、藥學、中藥學、生物制藥4個本科專業(yè)，構(gòu)建了完善的人才培養(yǎng)體系。目前在校本科生1238人、碩士研究生1317人、博士研究生134人。藥學學科入選“十四五”浙江省一流學科（A類），藥理學和毒理學進入全球前1%。擁有國家級科研平臺4個、省部級科研平臺8個，牽頭獲國家技術(shù)發(fā)明二等獎1項、省部級科技獎30余項。近五年，獲授權(quán)發(fā)明專利600余件，承擔國家和省部級科研項目200余項，其中國家重點研發(fā)計劃重點專項4項、國家重點研發(fā)計劃課題5項，年均科研到款近6000萬元。

新時代新征程，學院將以一流學科建設為主線，推動人才培養(yǎng)、科學研究、社會服務、文化傳承創(chuàng)新等各項事業(yè)高質(zhì)量發(fā)展，加快建設區(qū)域特色鮮明的應用研究型學院，著力在貫徹落實習近平總書記主政浙江期間對學校提出的“兩個基地”重要辦學指示上走在前列，努力為浙江打造生命健康科創(chuàng)高地、培育以醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)為龍頭的萬億健康產(chǎn)業(yè)，為建設健康中國作出更大貢獻。