學(xué)院前身是南京中醫(yī)學(xué)院1985年成立的“中醫(yī)計(jì)算機(jī)應(yīng)用研究中心”，2003年成立了信息技術(shù)學(xué)院。2019年6月，為了加強(qiáng)現(xiàn)代信息技術(shù)對醫(yī)藥類主干學(xué)科的支撐融合，發(fā)展人工智能、智能醫(yī)學(xué)和醫(yī)學(xué)信息工程與技術(shù)，學(xué)院更名為人工智能與信息技術(shù)學(xué)院。目前學(xué)院擁有“計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)”國家一流本科專業(yè)和校級重點(diǎn)學(xué)科、“軟件工程”江蘇省一流本科專業(yè)和校級重點(diǎn)培育學(xué)科，與文獻(xiàn)所共建“中醫(yī)藥信息學(xué)”國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科，擁有“南京中醫(yī)藥大學(xué)唐仲英中醫(yī)疫病研究中心”和江蘇省智慧中醫(yī)藥健康服務(wù)工程研究中心，設(shè)有“計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)”、“軟件工程”、“醫(yī)學(xué)信息工程”、“人工智能”4個(gè)本科專業(yè)，以及“軟件工程”一級學(xué)科碩士點(diǎn)、“中醫(yī)藥信息學(xué)”自主設(shè)置二級學(xué)科博碩士點(diǎn)，在校學(xué)生近700人。

學(xué)院下設(shè)中醫(yī)藥人工智能系、醫(yī)學(xué)信息系、計(jì)算機(jī)系、智能軟件系等4個(gè)系，計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)部、數(shù)學(xué)教學(xué)部、物理教學(xué)部等3個(gè)教學(xué)部，以及“信息技術(shù)實(shí)驗(yàn)中心”和“醫(yī)藥信息技術(shù)實(shí)踐教育中心”2個(gè)省級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心。現(xiàn)有教職工77人，其中專任教師65人，具有高級職稱約占46%、具有博士學(xué)位約占66%，博士生導(dǎo)師3人、碩士生導(dǎo)師13人；江蘇省教學(xué)名師1人、江蘇省有突出貢獻(xiàn)中青年專家1人、江蘇省高校“青藍(lán)工程”科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)1個(gè)、江蘇省“333工程”中青年科學(xué)技術(shù)帶頭人3人、江蘇省“六大人才高峰”培養(yǎng)對象3人、江蘇省高校“青藍(lán)工程”中青年學(xué)術(shù)帶頭人2人、江蘇省高?！扒嗨{(lán)工程”優(yōu)秀青年骨干教師5人；青年教師中有近20人赴澳大利亞悉尼大學(xué)、西悉尼大學(xué)、斯威本科技大學(xué)、美國弗吉尼亞大學(xué)等高校進(jìn)行課程培訓(xùn)和學(xué)術(shù)交流。近3年學(xué)院專任教師主持國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃子課題等國家級項(xiàng)目17項(xiàng)，獲山東省科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、全國商業(yè)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、全國高校微課教學(xué)比賽三等獎(jiǎng)等省部級教學(xué)科研成果獎(jiǎng)20多項(xiàng)。

學(xué)院積極探索教書育人的新思路、新方法，立足制度創(chuàng)新、方法創(chuàng)新、活動(dòng)內(nèi)容和形式創(chuàng)新，有效實(shí)施學(xué)生教育、管理和服務(wù)工作。選拔優(yōu)秀教師擔(dān)任本科生導(dǎo)師，全體教師黨員與學(xué)生班級共建，教師指導(dǎo)學(xué)生開展第二課堂教學(xué)、開辦學(xué)術(shù)講座、開展師生共建等豐富多彩的活動(dòng)，學(xué)院形成了良好的育人環(huán)境，大學(xué)生綜合素質(zhì)和實(shí)踐能力得到全面提高。通過學(xué)賽結(jié)合、一室一賽、科研反哺教學(xué)等措施，近3年指導(dǎo)學(xué)生在中國“互聯(lián)網(wǎng)+”大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽、“挑戰(zhàn)杯”全國大學(xué)生課外學(xué)術(shù)科技作品競賽、全國大學(xué)生數(shù)學(xué)建模競賽、中國大學(xué)生服務(wù)外包創(chuàng)業(yè)創(chuàng)新大賽、中國大學(xué)生計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)大賽、“藍(lán)橋杯”全國軟件和信息技術(shù)專業(yè)人才大賽等國家級和省級學(xué)科競賽中獲獎(jiǎng)300余項(xiàng)，學(xué)生創(chuàng)新精神及實(shí)踐能力得到顯著提高。

學(xué)院建立了全面的就業(yè)指導(dǎo)服務(wù)體系，畢業(yè)生就業(yè)率均在學(xué)校名列前茅，且就業(yè)質(zhì)量高，專業(yè)對口率高，多數(shù)在IT企業(yè)、醫(yī)院、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、政府機(jī)關(guān)等企事業(yè)單位從事計(jì)算機(jī)相關(guān)工作。部分優(yōu)秀畢業(yè)生考入浙江大學(xué)、南京大學(xué)、東南大學(xué)、中山大學(xué)、哈爾濱工業(yè)大學(xué)、華東師范大學(xué)、英國謝菲爾德大學(xué)、英國伯明翰大學(xué)、英國約克大學(xué)、澳大利亞墨爾本大學(xué)、澳洲國立大學(xué)、圣安德魯斯大學(xué)、斯威本科技大學(xué)等國內(nèi)外知名大學(xué)攻讀碩士研究生。

學(xué)院已與10多家軟件企業(yè)建立了實(shí)習(xí)基地，同時(shí)依托學(xué)校所建立的江蘇省中醫(yī)院等50多家附屬醫(yī)院和臨床實(shí)習(xí)醫(yī)院，為本科生的教學(xué)實(shí)踐和畢業(yè)實(shí)習(xí)提供了廣闊的實(shí)習(xí)實(shí)踐平臺。