南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的前身為國立中央大學(xué)醫(yī)學(xué)院，創(chuàng)建于1927年，1932年獨立建院，1935年國立中央大學(xué)重建醫(yī)學(xué)院，1949年解放后改名為南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院，1951年劃歸部隊系統(tǒng)，1987年經(jīng)教育部（原國家教委）批準再度重建，成為教育部直屬的第一所綜合性大學(xué)七年制醫(yī)學(xué)院。南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院以精品式、國際化、研究型為特色，人才培養(yǎng)目標是培養(yǎng)杰出的領(lǐng)導(dǎo)型臨床學(xué)家和醫(yī)學(xué)科學(xué)家，辦學(xué)理念和人才培養(yǎng)獨具特色。現(xiàn)設(shè)臨床醫(yī)學(xué)和口腔醫(yī)學(xué)兩個專業(yè)，均為國家級一流專業(yè)，實行本碩博貫通培養(yǎng)?，F(xiàn)有臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)兩個一級學(xué)科博士點、臨床醫(yī)學(xué)和口腔醫(yī)學(xué)兩個專業(yè)學(xué)位博士授予點、臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)兩個博士后流動站。美國科技信息所的ESI數(shù)據(jù)庫最新統(tǒng)計結(jié)果顯示：醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科進入全球排名前千分之一。

南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院目前有6所附屬醫(yī)院：附屬鼓樓醫(yī)院、附屬金陵醫(yī)院（東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院）、附屬口腔醫(yī)院、附屬泰康仙林鼓樓醫(yī)院、附屬鹽城第一醫(yī)院（鹽城市第一人民醫(yī)院）和附屬蘇州醫(yī)院，并以南京市各專科醫(yī)院作為教學(xué)醫(yī)院，師資力量雄厚，現(xiàn)有中國科學(xué)院院士1名、中國工程院院士2名，博士生導(dǎo)師139人，教授142人，副教授207人。近年來，學(xué)院在學(xué)科建設(shè)、隊伍建設(shè)、科學(xué)研究、社會服務(wù)各項工作取得了長足的發(fā)展。目前擁有國家慢性腎病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家遺傳工程小鼠資源庫、模式動物與疾病研究教育部重點實驗室以及江蘇省醫(yī)學(xué)分子技術(shù)重點實驗室等多個國家級及省部級科研中心/研究平臺；建立了23個臨床研究所，為開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究提供了平臺支撐；近5年共承擔(dān)了430余項國家自然科學(xué)基金項目以及20余項科技部重點研發(fā)項目/課題；近年來多次獲得國家和部委、省市科技獎勵。

憑借南京大學(xué)雄厚的自然科學(xué)基礎(chǔ)，濃郁的學(xué)術(shù)和人文氛圍，本院尤其注重加強學(xué)生的基礎(chǔ)理論、創(chuàng)新思維及科研能力和人文素質(zhì)的培養(yǎng)，教學(xué)內(nèi)容反映現(xiàn)代水平，并開設(shè)大量與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論和臨床有關(guān)的通識通修課，使學(xué)生既具有廣博而堅實的生命科學(xué)和自然科學(xué)基礎(chǔ)，又掌握現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論和必要的臨床知識與實踐技能。

學(xué)院國際交流頻繁，與美國約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院、澳大利亞西澳大學(xué)醫(yī)學(xué)院、香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院等簽署學(xué)生交流協(xié)議，每年遴選優(yōu)秀學(xué)生赴上述大學(xué)醫(yī)學(xué)院進行交流。2021年起，與英國利茲大學(xué)共同建立了口腔醫(yī)學(xué)碩士研究生的聯(lián)合培養(yǎng)項目。

建院三十多年來，南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院已培養(yǎng)一大批優(yōu)秀畢業(yè)生，這些畢業(yè)生絕大多數(shù)在全國各大城市的三級甲等醫(yī)院中從事臨床工作，在工作中都有出色的表現(xiàn)，其中相當(dāng)一部分在業(yè)務(wù)上已有所建樹或成為所在單位的骨干。用人單位在評價南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的畢業(yè)生時一致認為：我院畢業(yè)生基礎(chǔ)扎實、思維敏捷、知識面寬，有較強的研究能力和創(chuàng)新能力，并十分關(guān)注醫(yī)學(xué)發(fā)展的前沿動態(tài)，在醫(yī)學(xué)臨床和研究領(lǐng)域有很強的競爭力。