南京信息工程大學(xué)高等教育研究所成立于2006年，是學(xué)校從事高等教育研究的專門機構(gòu)，也是為學(xué)校發(fā)展提供決策參考的咨詢機構(gòu)。部門主要承擔(dān)學(xué)校發(fā)展和運行過程中的高等教育學(xué)有關(guān)的理論研究、政策研究、研究生培養(yǎng)等職能。高等教育研究所現(xiàn)有教職工5人，其中博士4人，碩士1人；教授1人，副教授4人；另有兼職研究人員數(shù)人。

高等教育研究所以高等教育理論研究為基礎(chǔ)，服務(wù)學(xué)校各項事業(yè)發(fā)展。在教育科研方面取得顯著成績，承擔(dān)和完成省部級以上項目30余項（其中包括國家社科基金、全國教育規(guī)劃教育部重點課題、教育部人文社科項目、江蘇省社科基金重點項目等），在研省部級項目10余項；在《高等教育研究》、《中國高教研究》、《比較教育研究》等高等教育期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文200余篇；出版教育教學(xué)研究專著10本；獲得國家教學(xué)成果獎2項，全國教育科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎2項，江蘇省高等教育教學(xué)成果特等獎2項，全國教育科學(xué)研究成果獎2項，江蘇省省哲學(xué)社會科學(xué)獎5項。在政策研究方面：積極為學(xué)校的發(fā)展決策服務(wù)，先后承擔(dān)了學(xué)院制改革、實驗室管理體制改革、大學(xué)學(xué)分制、工科學(xué)院發(fā)展、學(xué)部制改革、高等教育國際化、技術(shù)產(chǎn)業(yè)化、局省共建、大學(xué)章程、大學(xué)排名、氣象學(xué)科排名等學(xué)校重大項目，對學(xué)校快速發(fā)展和科學(xué)決策起到了重要作用。同時，為充分調(diào)動全校教職工參與學(xué)校發(fā)展及日常運行的建言獻策的積極性，提高我校決策的科學(xué)性，部門設(shè)立了“高等教育調(diào)研及政策研究課題”并實施管理。在研究生培養(yǎng)方面，在馬克思主義學(xué)院、法政學(xué)院、 教師教育學(xué)院招收碩士研究生，已培養(yǎng)了多名優(yōu)秀畢業(yè)生，在管理工程學(xué)院招收博士研究生。

高等教育研究所積極開展多種形式的學(xué)術(shù)活動和社會服務(wù)，多次應(yīng)邀主持和參加省內(nèi)外相關(guān)單位組織的教育咨詢、政策制定、教學(xué)評估、項目評審、講學(xué)講座等活動， 2011年、2015年、2018年、2020年、2022年連續(xù)五屆被評為“江蘇省教育科研先進集體”，2008年、2015年、2017年連續(xù)三屆獲得“全國優(yōu)秀高等教育研究機構(gòu)”。