化學(xué)工程學(xué)院前身可追溯至1929年，由我國(guó)杰出的林學(xué)家、教育家、社會(huì)活動(dòng)家、新中國(guó)首任林墾部長(zhǎng)梁希先生在浙江大學(xué)籌建并在原中央大學(xué)正式創(chuàng)辦的森林化學(xué)室。1952年全國(guó)高校院系調(diào)整時(shí)，由原中央大學(xué)森林系與金陵大學(xué)森林系合并組建南京林學(xué)院，以原中央大學(xué)的森林化學(xué)室為基礎(chǔ)開(kāi)設(shè)林產(chǎn)化工專業(yè)，1955年華中農(nóng)學(xué)院林學(xué)系（武漢大學(xué)、南昌大學(xué)和湖北農(nóng)學(xué)院森林系合并組成）并入南京林學(xué)院，林產(chǎn)化學(xué)加工專業(yè)師資隊(duì)伍得到了加強(qiáng)。1956年首次招收林產(chǎn)化工專業(yè)本科生，1957年招收研究生。1959年5月，成立林產(chǎn)化學(xué)工程系，1964年增設(shè)木材制漿專業(yè)方向，1981年林產(chǎn)化學(xué)加工工程成為我國(guó)首批博士點(diǎn)，1982年增設(shè)制漿造紙專業(yè)，1986年增設(shè)了木材保護(hù)與改性和香料兩個(gè)?？茖I(yè)，1993年設(shè)精細(xì)化工本科專業(yè)，同年12月林產(chǎn)化工系更名為化學(xué)工程學(xué)院。1999年學(xué)院設(shè)置化學(xué)工程與工藝本科專業(yè)，2000、2002和2010年先后獲批生物化工、化學(xué)工藝和化學(xué)工程二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)，2011年獲批化學(xué)工程與技術(shù)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)。2008年，學(xué)校院系調(diào)整將本院輕化工程和印刷工程兩個(gè)專業(yè)組建成立輕工科學(xué)與工程學(xué)院。2014年，學(xué)院環(huán)境工程專業(yè)組建成立生物與環(huán)境學(xué)院。學(xué)院的特色優(yōu)勢(shì)學(xué)科及支撐學(xué)科為林產(chǎn)化學(xué)加工工程學(xué)科，該學(xué)科獲批我國(guó)首批博士點(diǎn)學(xué)科，并從1989年起被評(píng)為國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科。該學(xué)科所支撐的我校林業(yè)工程一級(jí)學(xué)科自2017年連續(xù)入選國(guó)家“雙一流”學(xué)科建設(shè)行列，學(xué)院成為支撐我校一流學(xué)科建設(shè)的核心學(xué)院。

學(xué)院擁有國(guó)家林業(yè)局林產(chǎn)化學(xué)加工重點(diǎn)開(kāi)放性實(shí)驗(yàn)室、江蘇省生物質(zhì)綠色燃料與化學(xué)品重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省高校農(nóng)林生物質(zhì)化學(xué)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育點(diǎn)、林業(yè)資源生物化學(xué)加工學(xué)科綜合訓(xùn)練中心和江蘇省高等學(xué)?；A(chǔ)課實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心（化學(xué)工程實(shí)驗(yàn)中心）；學(xué)院是江蘇省人民政府、國(guó)家林業(yè)草原局省部共建“林產(chǎn)化學(xué)與材料國(guó)際創(chuàng)新高地”、江蘇省林業(yè)資源高效加工利用協(xié)同創(chuàng)新中心的核心組成部分。

學(xué)院設(shè)林產(chǎn)化工系、精細(xì)化工系、生物工程系、化學(xué)工程系、制藥工程系和應(yīng)用化學(xué)系。擁有林業(yè)工程博士后流動(dòng)站，林產(chǎn)化學(xué)加工工程、生物質(zhì)能源科學(xué)與技術(shù)2個(gè)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，化學(xué)工程與技術(shù)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位（生物化工、化學(xué)工藝、化學(xué)工程、應(yīng)用化學(xué)4個(gè)二級(jí)學(xué)科）授權(quán)點(diǎn)，林產(chǎn)化學(xué)加工工程、生物質(zhì)能源科學(xué)與技術(shù)二級(jí)學(xué)科學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，以及材料與化工、生物與醫(yī)藥專業(yè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。學(xué)院現(xiàn)有林產(chǎn)化工、化學(xué)工程與工藝、生物工程、生物制藥4個(gè)本科專業(yè)，其中林產(chǎn)化工、生物工程、化學(xué)工程與工藝為國(guó)家一流專業(yè)，生物制藥為江蘇省一流專業(yè)。在校博士研究生120余人，碩士研究生450余人，本科生1500余人。

學(xué)院現(xiàn)有教職工120人，其中教授46人、副教授48人，博士生導(dǎo)師42人，碩士生導(dǎo)師61人。擁有國(guó)家級(jí)人才、四青人才、雙聘院士、江蘇省“333工程”第二層次、江蘇省特聘教授等國(guó)家和省部級(jí)人才20余人。榮獲國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)/二等獎(jiǎng)、國(guó)家技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)等國(guó)家級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)、梁希林業(yè)科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)、江蘇省科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)等17項(xiàng)。近5年來(lái)，學(xué)院先后承擔(dān)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等重要科研項(xiàng)目（課題）150余項(xiàng)，年發(fā)表SCI論文400余篇，年授權(quán)發(fā)明專利140余件。

學(xué)院高度重視本科創(chuàng)新人才培養(yǎng)，近年來(lái)屢獲“互聯(lián)網(wǎng)+”“挑戰(zhàn)杯”等學(xué)科競(jìng)賽國(guó)家級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)。學(xué)院每年在林產(chǎn)化工及相關(guān)專業(yè)中選拔優(yōu)秀學(xué)生組建“梁希班”，實(shí)行“一對(duì)一”學(xué)業(yè)導(dǎo)師制培養(yǎng)，選拔優(yōu)秀學(xué)生參與學(xué)院“國(guó)際創(chuàng)新型化學(xué)人才”培養(yǎng)計(jì)劃，先后赴美國(guó)、英國(guó)等國(guó)外高校開(kāi)展短期學(xué)習(xí)交流。此外，與英國(guó)斯特萊斯克萊德大學(xué)簽訂了本科生“3+1+1”合作協(xié)議，本科生在國(guó)內(nèi)完成大學(xué)3年學(xué)習(xí)后擇優(yōu)選拔赴英國(guó)學(xué)習(xí)1年，畢業(yè)時(shí)授予南京林業(yè)大學(xué)學(xué)士學(xué)位，繼續(xù)赴英國(guó)學(xué)習(xí)1年后可獲授予英國(guó)斯特萊斯克萊德大學(xué)碩士學(xué)位。