上海中醫(yī)藥大學積極開展聯(lián)合培養(yǎng)項目，涵蓋本科、碩士及博士等多個層次，與國內外多所高校、醫(yī)療機構及研究機構合作，旨在培養(yǎng)高素質的中醫(yī)藥人才。

研究生聯(lián)合培養(yǎng)：

與上海中醫(yī)藥大學附屬曙光醫(yī)院、岳陽中西醫(yī)結合醫(yī)院等醫(yī)療機構合作開展研究生培養(yǎng)，例如聯(lián)合培養(yǎng)藥理學及中藥學專業(yè)碩士研究生，通過開題答辯、課程共建等方式提升科研與臨床能力。

與高水平大學如上海交通大學、華東師范大學聯(lián)合舉辦中醫(yī)學“5+3”一體化專業(yè)（本碩連讀），以及與中國中醫(yī)科學院合辦中醫(yī)學專業(yè)本博連讀“屠呦呦班”，探索未來臨床科學家的培養(yǎng)路徑。

與企業(yè)及產業(yè)機構合作，如與上海中醫(yī)藥大學光明中醫(yī)醫(yī)院共建康復醫(yī)學基地，推動中西醫(yī)結合、智能康復等領域的創(chuàng)新人才培養(yǎng)。

特色人才培養(yǎng)計劃：

學校推行“一體兩翼”理念，試點長學制培養(yǎng)項目，如“屠呦呦班”“沛然計劃”“中西醫(yī)匯聚創(chuàng)新班”等，注重師承教育與臨床實踐結合。

在研究生培養(yǎng)中，強調過程管理與質量保障，例如通過聯(lián)合開題答辯、綜合素質評價等方式優(yōu)化培養(yǎng)流程。