南京大學數(shù)學學院源于中央大學數(shù)學系和金陵大學數(shù)學系。中大數(shù)學系的前身是1921年成立的國立東南大學數(shù)學系，創(chuàng)辦者是熊慶來教授。1952年高等院校調(diào)整，1955年與天文系合并成立了南京大學數(shù)天系，1961年數(shù)天系分離成數(shù)學系和天文系，1978年計算機技術從數(shù)學系分離成立計算機系，此后數(shù)學學院的基本格局保持不變。南京大學數(shù)學學院以歷史悠久、實力雄厚、治學嚴謹而著稱。自建系以來，一批杰出的數(shù)學家先后在院執(zhí)教，奠定了本院的學科構(gòu)架和特色，形成較為完備的教學體系，其學術影響一直處于國內(nèi)領先地位，蜚聲海外。

數(shù)學學院現(xiàn)有數(shù)學與應用數(shù)學（國家級一流本科專業(yè)建設點、教育部特色專業(yè)建設點）、信息與計算科學（國家級一流本科專業(yè)建設點）、統(tǒng)計學三個本科專業(yè)，形成了本科生、碩士生、博士生和博士后的完整培養(yǎng)體系。數(shù)學學院著力提升國家一級重點學科、國家理科基礎科學研究和教學人才培養(yǎng)基地的內(nèi)涵，鞏固和做強已有的優(yōu)勢學科方向，同時帶動其它方向的發(fā)展，形成了若干個在國內(nèi)有重要影響、特色鮮明的研究方向。動力系統(tǒng)、微分方程、數(shù)論與K理論、科學工程計算等方向在國際上已經(jīng)有了較大的影響。

南京大學數(shù)學學科是國家一級重點學科、江蘇省優(yōu)勢學科，是國家理科基礎科學研究和教學人才培養(yǎng)基地、教育部基礎學科拔尖學生培養(yǎng)計劃2.0基地，擁有數(shù)學和統(tǒng)計學兩個一級學科（其中數(shù)學為國家一級重點學科、統(tǒng)計學為江蘇省一級重點學科），擁有國家“211”三期重點建設項目 1 個、國家“985”工程科技創(chuàng)新Ⅱ級平臺 1 個、國家應用數(shù)學中心1個、 教育部創(chuàng)新團隊 1 個、省級應用數(shù)學中心1個、省級實驗教學與實踐教育中心 1 個、省級優(yōu)秀教學團隊3個，ESI 全球?qū)W科排名前 1%。