中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心（簡稱“分子植物卓越中心”，下同）是中國科學(xué)院直屬的獨(dú)立事業(yè)法人科研機(jī)構(gòu)，其前身是中國科學(xué)院上海植物生理生態(tài)研究所。1999年，原中國科學(xué)院上海植物生理研究所與原中國科學(xué)院上海昆蟲研究所整合成立中國科學(xué)院上海植物生理生態(tài)研究所。2016年，植物生理生態(tài)研究所依托分子植物卓越中心，設(shè)立中國科學(xué)院直屬科研機(jī)構(gòu)。2019年，分子植物卓越中心獲批獨(dú)立事業(yè)法人資格。

分子植物卓越中心按照黨中央、院黨組的決策部署，對標(biāo)對表習(xí)近平總書記對中國科學(xué)院提出的“四個(gè)率先”和“兩加快一努力”目標(biāo)要求，聚焦主責(zé)主業(yè)，狠抓工作落實(shí)，強(qiáng)化使命驅(qū)動的建制化基礎(chǔ)研究?！笆奈濉逼陂g，分子植物卓越中心將面向植物科學(xué)國際前沿，圍繞農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境安全的重大戰(zhàn)略需求，開展前瞻性、戰(zhàn)略性基礎(chǔ)和應(yīng)用基礎(chǔ)研究。發(fā)揮植物、昆蟲和合成生物學(xué)“三位一體”多學(xué)科優(yōu)勢，在植物遺傳、代謝、發(fā)育、生理及其與環(huán)境互作等前沿領(lǐng)域開展系統(tǒng)研究；力爭在作物雜種優(yōu)勢、作物碳氮高效、高碳匯植物創(chuàng)制、植物干細(xì)胞與再生、植物逆境應(yīng)答和免疫機(jī)制等方面取得重大理論突破和技術(shù)革新，為保障國家糧食安全與生態(tài)安全提供理論基礎(chǔ)和技術(shù)儲備，強(qiáng)化創(chuàng)新源頭供給。明確了以“植物碳氮高效”、“作物復(fù)雜性狀調(diào)控的理論基礎(chǔ)”和“植物與環(huán)境互作”作為主攻方向，“先進(jìn)合成生物學(xué)”、“植物多維組學(xué)”和“數(shù)字植物與定量生物學(xué)”為新興前沿方向和未來技術(shù)的整體布局。分子植物卓越中心將以強(qiáng)化國家戰(zhàn)略科技力量為導(dǎo)向，優(yōu)化及提升在人才隊(duì)伍、平臺支撐、資源配置、體制機(jī)制等方面的布局，匯聚一流的創(chuàng)新資源，以期建設(shè)成為分子植物前沿科學(xué)研究杰出的人才高地、重大成果發(fā)源地和國際一流的現(xiàn)代植物科學(xué)研究中心。

截至2022年底，分子植物卓越中心共有在職職工383人。其中科技人員243人、科技支撐人員61人，包括中國科學(xué)院院士7人、發(fā)展中國家科學(xué)院院士4人、研究員及正高級工程技術(shù)人員87人、副研究員及高級工程技術(shù)人員80人；全所進(jìn)入創(chuàng)新崗位304人。分子植物卓越中心是國務(wù)院學(xué)位評定委員會首批批準(zhǔn)的碩士、博士學(xué)位授予點(diǎn)，設(shè)有生物學(xué)一級學(xué)科博士研究生培養(yǎng)點(diǎn)，并設(shè)有生物學(xué)一級學(xué)科博士后流動站，共有在學(xué)研究生641人（其中碩士生231人、博士生410人），在站博士后95人。

分子植物卓越中心2022年共發(fā)表SCI研究論文350余篇。聚焦作物高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的育種目標(biāo)，成功挖掘出由兩個(gè)新基因TT3.1和TT3.2組成的抗熱遺傳模塊TT3，并揭示其協(xié)同調(diào)控水稻抗熱性的分子機(jī)制，為提高作物抗熱性以應(yīng)對氣候變暖引發(fā)的糧食安全問題提供珍貴基因資源（Science），成果入選2022年度中國生命科學(xué)十大進(jìn)展。圍繞創(chuàng)制高蛋白玉米的戰(zhàn)略需求，首次從野生玉米中克隆控制高蛋白含量主效基因Thp9，有效提高玉米蛋白含量，為培育高蛋白玉米和高品質(zhì)青儲玉米提供重要基因資源和育種材料(Nature)。在植物-昆蟲-微生物互作研究領(lǐng)域，合作揭示植物如何巧妙組裝其特異性代謝產(chǎn)物應(yīng)對農(nóng)業(yè)重大害蟲小葉蟬的非寄主抗性機(jī)制（Science，封面文章）。全年新增專利申請41件、其中PCT 5件、國外專利8件；新增授權(quán)專利39件，其中國外專利2件，軟件登記2件。分子植物卓越中心積極響應(yīng)鄉(xiāng)村振興和國家雙碳策略中充分利用邊際土地的政策，完成1000余份藜麥的雜交組合，培育了一系列有自主知識產(chǎn)權(quán)的品種以及高代品系，實(shí)現(xiàn)藜麥在高寒、干旱和鹽堿地推廣面積已經(jīng)達(dá)10萬余畝，并初步建立了實(shí)驗(yàn)室-地方政府-企業(yè)三位一體的推廣模式，同時(shí)也為后續(xù)放大推廣和其他高碳匯植物的應(yīng)用提供了樣板。

2022年，《分子植物》(Molecular Plant) 影響因子上升到21.949、排名躍居植物科學(xué)研究類期刊全球第一，榮獲中國最具國際影響力學(xué)術(shù)期刊、華東地區(qū)優(yōu)秀期刊等稱號。《分子植物》姊妹刊《植物通訊》（Plant Communications）獲得首個(gè)影響因子8.625、排名居植物科學(xué)研究類期刊第七?！吨参锷韺W(xué)報(bào)》繼續(xù)位居植物學(xué)類核心期刊前列。

分子植物卓越中心是中國植物生理與植物分子生物學(xué)學(xué)會、上海市植物生理與植物分子生物學(xué)學(xué)會、上海市昆蟲學(xué)會、上海市生物工程學(xué)會的掛靠單位。