中國(guó)科學(xué)院上海免疫與感染研究所（以下簡(jiǎn)稱(chēng)研究所）原名中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所，成立于2004年10月11日，是中國(guó)科學(xué)院直屬事業(yè)單位。研究所致力于重大感染性和傳染性疾病基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究，創(chuàng)新發(fā)展病原學(xué)、流行病學(xué)、免疫學(xué)和疫苗學(xué)理論，突破感染性和傳染性疾病免疫防治等關(guān)鍵核心技術(shù)，推動(dòng)新發(fā)再發(fā)傳染病研究國(guó)際合作，為全球公共健康提供創(chuàng)新理論、策略和解決方案。主要科研方向有： 重要病原與宿主互作的機(jī)理及應(yīng)對(duì)策略：圍繞呼吸道、消化道、體液、媒介等途徑傳播的重要病原，闡明病原致病性、宿主易感性以及免疫應(yīng)答的分子生物學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)基礎(chǔ)，揭示病原在宿主體內(nèi)建立急、慢性感染的關(guān)鍵機(jī)理, 探索感染預(yù)防和臨床干預(yù)的措施。重要病原發(fā)現(xiàn)、溯源及傳播機(jī)制：圍繞病原發(fā)現(xiàn)、監(jiān)測(cè)、預(yù)警中的關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題，開(kāi)展病原分離、鑒定、溯源、進(jìn)化與跨種傳播機(jī)制的研究，支撐重大傳染病的全球監(jiān)測(cè)與預(yù)警。傳染病防治技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)品研發(fā)：聚焦傳染病防治藥物研發(fā)、疫苗創(chuàng)制、免疫診治的前沿技術(shù)，重點(diǎn)創(chuàng)新抗體藥物和新型疫苗研發(fā)及制備技術(shù)；建立疫苗和抗體研發(fā)及評(píng)估的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，完善防治技術(shù)與產(chǎn)品創(chuàng)新鏈。傳染病與人體微生物組：研究全生命周期中，人體共生微生物與宿主的共進(jìn)化規(guī)律和調(diào)節(jié)宿主生理、病理的機(jī)制，揭示人體共生微生物在病原感染與致病過(guò)程中的微生態(tài)影響，及其在免疫響應(yīng)中的作用，并發(fā)展相應(yīng)的檢測(cè)診斷技術(shù)和干預(yù)策略。