中國科學(xué)院沈陽應(yīng)用生態(tài)研究所（以下簡稱沈陽生態(tài)所）成立于1954年，其前身為中國科學(xué)院林業(yè)土壤研究所，1987年更為現(xiàn)名，2001年成為國家知識創(chuàng)新工程試點單位，2015年成為中國科學(xué)院“生態(tài)文明建設(shè)”領(lǐng)域首批特色研究所試點單位。

建所以來，圍繞現(xiàn)代農(nóng)林業(yè)可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境建設(shè)中亟需解決的重大科技問題，結(jié)合應(yīng)用生態(tài)學(xué)發(fā)展需要，沈陽生態(tài)所在森林生態(tài)與林業(yè)生態(tài)工程、土壤生態(tài)與農(nóng)業(yè)生態(tài)工程、污染生態(tài)與環(huán)境生態(tài)工程領(lǐng)域開展基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性研究，完善和創(chuàng)新應(yīng)用生態(tài)學(xué)理論、方法和技術(shù)體系；聚焦退化生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)-重建與生態(tài)安全、黑土地保護(hù)-利用與糧食安全、污染環(huán)境治理-改善與低碳綠色發(fā)展，為東北工農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化和新型城鎮(zhèn)化提供生態(tài)與環(huán)境保障，為生態(tài)文明-美麗中國建設(shè)提供科技支撐。

沈陽生態(tài)所設(shè)有3個研究中心，分別是森林生態(tài)與林業(yè)生態(tài)工程研究中心、土壤生態(tài)與農(nóng)業(yè)生態(tài)工程研究中心、污染生態(tài)與環(huán)境生態(tài)工程研究中心?，F(xiàn)有1個國地聯(lián)合實驗室、3個院級實驗室、11個省級實驗室和專業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心，分別是污染土壤生物-物化協(xié)同修復(fù)技術(shù)國家地方聯(lián)合工程實驗室、中國科學(xué)院污染生態(tài)與環(huán)境工程重點實驗室、中國科學(xué)院森林生態(tài)與管理重點實驗室、中國科學(xué)院綠色肥料工程實驗室、遼寧省節(jié)水農(nóng)業(yè)重點實驗室、遼寧省生態(tài)公益林經(jīng)營管理重點實驗室、遼寧省植物資源保護(hù)與利用重點實驗室、遼寧省土壤污染控制與生態(tài)修復(fù)重點實驗室、遼寧省環(huán)境計算與可持續(xù)發(fā)展重點實驗室、遼寧省穩(wěn)定同位素技術(shù)重點實驗室、遼寧省現(xiàn)代保護(hù)性耕作與生態(tài)農(nóng)業(yè)重點實驗室、遼寧省陸地生態(tài)系統(tǒng)碳中和重點實驗室、遼寧省肥料專業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心、遼寧省污染環(huán)境生態(tài)修復(fù)專業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心、遼寧省農(nóng)產(chǎn)品環(huán)境及質(zhì)量安全控制專業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心。

研究所在不同地帶、不同類型地區(qū)建有10個野外站，包括4個國家站（同為CERN站），分別是吉林長白山森林生態(tài)系統(tǒng)國家野外科學(xué)觀測研究站、遼寧沈陽農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)國家野外科學(xué)觀測研究站、湖南會同森林生態(tài)系統(tǒng)國家野外科學(xué)觀測研究站、遼寧清原森林生態(tài)系統(tǒng)國家野外科學(xué)觀測研究站；包括3個所級站，分別是烏蘭敖都荒漠化試驗站、額爾古納森林草原過渡帶生態(tài)系統(tǒng)研究站、大青溝沙地生態(tài)實驗站；包括3個與國家林草局共建站，分別是吉林長白山西坡森林生態(tài)系統(tǒng)定位站、內(nèi)蒙古額爾古納濕地生態(tài)系統(tǒng)定位觀測研究站、遼寧沈陽城市生態(tài)系統(tǒng)定位觀測研究站。

研究所建有被譽(yù)為“大城市中小森林”之稱的沈陽樹木園，園區(qū)占地達(dá)135公頃（包括萬柳塘園區(qū)和輝山分園），建有展覽溫室和實驗溫室3000平方米；目前園內(nèi)擁有植物專類區(qū)25個，保育植物資源2600余種，珍稀瀕危植物61種；現(xiàn)遷地保育原生種植物1194種、本土植物1800余種、國家重點保護(hù)野生植物41種；此外，保存IUCN珍稀瀕危植物38種、《中國生物多樣性紅色名錄》珍稀瀕危植物56種；完成東北地區(qū)受威脅物種60%以上的有效保護(hù)。

研究所擁有東北地區(qū)最大的生物標(biāo)本館，館藏標(biāo)本61萬份，其中包括維管束植物標(biāo)本29萬份，苔蘚標(biāo)本13萬份，地衣標(biāo)本3萬份，高等真菌標(biāo)本4萬份，昆蟲標(biāo)本7.2萬份，病害標(biāo)本1萬份，木材標(biāo)本1千份，微生物標(biāo)本2萬份及土壤標(biāo)本2萬份。

沈陽生態(tài)所是1981年國務(wù)院學(xué)位委員會首次批準(zhǔn)的博士學(xué)位點，現(xiàn)設(shè)有生態(tài)學(xué)、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境2個一級學(xué)科博士研究生培養(yǎng)點，微生物學(xué)、環(huán)境科學(xué)2個二級學(xué)科博士研究生培養(yǎng)點，生態(tài)學(xué)、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境2個一級學(xué)科碩士研究生培養(yǎng)點，微生物學(xué)、植物學(xué)、森林培育、環(huán)境科學(xué)等4個專業(yè)二級學(xué)科碩士研究生培養(yǎng)點；并設(shè)有生態(tài)學(xué)、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境2個一級學(xué)科博士后流動站。

截至2023年底，我所在崗職工467人。其中，在崗的專業(yè)技術(shù)人員312人，包括正高級91人、副高級106人、中初級115人。擁有院士1人；國家杰出青年基金獲得者2人；國家優(yōu)秀青年基金獲得者11人，在學(xué)研究生389人，其中博士208人，碩士181人，在站博士后55人。

截至2023年底，共獲得省部級以上獎勵240余項，其中國家獎34項，省部級獎213項，出版專著近320余部，發(fā)表論文12000余篇，其中SCI論文超過5300篇: 授權(quán)專利653項。

沈陽生態(tài)所與美國、英國、德國、比利時、俄羅斯、瑞士、日本等國家的眾多高水平大學(xué)和科研機(jī)構(gòu)開展卓有成效的合作研究與學(xué)術(shù)交流，與國內(nèi)知名高校和相關(guān)企業(yè)建立了合作關(guān)系。

沈陽生態(tài)所是遼寧省生態(tài)學(xué)會、遼寧省植物學(xué)會、遼寧省土壤學(xué)會、沈陽市植物學(xué)會的掛靠單位；主辦中文期刊《應(yīng)用生態(tài)學(xué)報》《生態(tài)學(xué)雜志》，及SCIE期刊Ecological Processes等學(xué)術(shù)刊物。