中國科學院新疆生態(tài)與地理研究所（以下簡稱新疆生地所）成立于1998年7月7日，由新疆生物土壤沙漠研究所（1961年成立）和新疆地理研究所（1965年成立）合并而成。

新疆生地所面向國際干旱區(qū)生態(tài)與環(huán)境領域科技前沿，面向國家絲綢之路經(jīng)濟帶建設重大需求，面向新疆社會穩(wěn)定與長治久安總目標，創(chuàng)新干旱區(qū)科學的理論和方法體系，在干旱區(qū)生態(tài)學與干旱區(qū)地理學領域，圍繞干旱區(qū)自然資源開發(fā)、生態(tài)修復、環(huán)境治理、生物多樣性保育和區(qū)域可持續(xù)發(fā)展等重大問題開展研究和試驗示范，在亞洲中部干旱區(qū)生態(tài)與環(huán)境領域發(fā)揮不可替代的骨干和引領作用。

研究所建有荒漠與綠洲生態(tài)國家重點實驗室（干旱區(qū)生態(tài)安全與可持續(xù)發(fā)展重點實驗室）、國家荒漠-綠洲生態(tài)建設工程技術研究中心、新疆礦產(chǎn)資源研究中心、中國科學院中亞生態(tài)與環(huán)境研究中心，以及新疆旅游研究院、絲路綠色發(fā)展研究中心等研究所內設研究單元。國內建有12個野外觀測研究站（其中3個為國家站），在中亞、伊朗和蒙古國建有19個國際聯(lián)合野外觀測研究站；建有院大型儀器區(qū)域中心、文獻信息中心、新疆自然博物館等支撐平臺。建有“一帶一路”國際科學組織聯(lián)盟荒漠化專題聯(lián)盟（ANSO-ACD）；與相關國外機構聯(lián)合，建有干旱區(qū)生物多樣性保護聯(lián)合體（BCAA）、中美國際干旱區(qū)生態(tài)研究中心、中日干旱區(qū)生態(tài)研究中心、中國-比利時地理信息聯(lián)合實驗室、東非自然資源與環(huán)境研究中心、泛非綠色長城研究中心、中德干旱區(qū)生態(tài)系統(tǒng)管理與環(huán)境變化聯(lián)合研究中心等。

作為“四類機構”特色研究所，全面完成十三五“一三五”規(guī)劃，當前，研究所“十四五”規(guī)劃全面實施，聯(lián)合中國科學院西北生態(tài)環(huán)境資源研究院建設“干旱區(qū)生態(tài)安全與可持續(xù)發(fā)展重點實驗室”，第三次新疆綜合科學考察大數(shù)據(jù)平臺項目穩(wěn)步推進，干旱區(qū)種質資源庫建設取得實質進展，“伊犁-吐魯番國家植物園”納入國家植物園規(guī)劃建設序列。

截至2023年底，研究所共有職工618人，其中崗位聘用375人、項目聘用98人（包含特別研究助理及博士后81人），客座及訪問學者145人。

新疆生地所是1983年國務院學位委員會批準的博士、碩士學位授予權單位之一，現(xiàn)設有地理學、生物學、生態(tài)學、地質資源與地質工程四個專業(yè)一級學科博士研究生培養(yǎng)點；設有自然地理學、人文地理學、地圖學與地理信息系統(tǒng)、植物學、生態(tài)學、地球探測與信息技術六個專業(yè)二級學科博士研究生培養(yǎng)點；設有自然地理學、人文地理學、地圖學與地理信息系統(tǒng)、植物學、生態(tài)學、環(huán)境科學、地球探測與信息技術（工學碩士）、水土保持與荒漠化防治（農(nóng)學碩士）八個學術型碩士研究生培養(yǎng)點及資源與環(huán)境、生物與醫(yī)藥兩個專業(yè)學位碩士研究生培養(yǎng)點。截至2023年底，研究所有在讀研究生458人，其中博士研究生178人、碩士研究生215人、國際學生65人。

扎根邊疆60多年來，圍繞新疆經(jīng)濟、社會發(fā)展的關鍵科技問題，開展了深入、長期的科學試驗、考察和定位研究，累計承擔課題3000多項，積累了豐富的科學資料，取得了豐碩的科研成果，獲得國際、國家、省部級獎勵近400項，支持了新疆的經(jīng)濟社會發(fā)展，幫助了各族農(nóng)牧民實現(xiàn)科技脫貧致富。

新疆與周邊八國相鄰，研究所在60多年的發(fā)展歷程中，一直高度重視國際合作工作。近年來，尤其是“一帶一路”倡議實施以來，研究所國際科技合作交流迅速發(fā)展，國際合作層次不斷提升，實現(xiàn)了從一般交流向實質性合作的轉變，從分散向區(qū)域集成合作的轉變，從跟蹤參與向牽頭組織國際合作大項目的轉變，推動了人才培養(yǎng)和科研創(chuàng)新能力的提高，助力周邊國家科技進步、民生改善，提升了研究所在國際同行中的知名度和影響力。