杭州醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院歷史悠久，1931年起設(shè)立公共衛(wèi)生專業(yè)，1978年設(shè)立衛(wèi)生學(xué)科，2001年成立公共衛(wèi)生系、2016年更名為公共衛(wèi)生學(xué)院；2019年10月杭州醫(yī)學(xué)院與浙江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院合并，原省醫(yī)科院衛(wèi)生學(xué)研究所和職業(yè)病防治研究所并入公共衛(wèi)生學(xué)院。2021年6月，學(xué)校與浙江省疾病預(yù)防控制中心成立聯(lián)合公共衛(wèi)生學(xué)院，省疾控中心選派院長、副院長，推動協(xié)同發(fā)展，資源全面互通，成果全面共享，打造高校疾控聯(lián)合辦學(xué)新模式。

學(xué)院現(xiàn)有在編教職員工67人，有公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)一級學(xué)科碩士點、公共衛(wèi)生專業(yè)學(xué)位碩士點。開設(shè)預(yù)防醫(yī)學(xué)（五年制）本科專業(yè)和衛(wèi)生信息管理?？茖I(yè)。2003年，啟動“勞動衛(wèi)生學(xué)”浙江省醫(yī)學(xué)重點學(xué)科建設(shè)工作；2016年，“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”學(xué)科入選為浙江省“十三五”一流學(xué)科建設(shè)項目（B類）；2022年，“預(yù)防醫(yī)學(xué)”專業(yè)獲批省一流專業(yè)建設(shè)點；2023年，“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”學(xué)科入選為“十四五”浙江省一流學(xué)科（A類）。