農(nóng)業(yè)與生態(tài)工程學(xué)院現(xiàn)設(shè)有種子科學(xué)與工程、農(nóng)學(xué)、園藝、菌物科學(xué)與工程4個本科專業(yè)。其中種子科學(xué)與工程專業(yè)為國家級特色專業(yè)、省級一流本科專業(yè)建設(shè)點，國家急需緊缺涉農(nóng)專業(yè)專項招生計劃專業(yè)；園藝專業(yè)為省級特色專業(yè)、省級一流本科專業(yè)建設(shè)點；農(nóng)學(xué)專業(yè)為傳統(tǒng)優(yōu)勢專業(yè)，校級一流專業(yè)建設(shè)點；菌物科學(xué)與工程專業(yè)為新興優(yōu)勢專業(yè)。農(nóng)業(yè)碩士被教育部批準為碩士點，2023年已開招生。

學(xué)院始終圍繞應(yīng)用型人才培養(yǎng)目標，緊密結(jié)合現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展需要，以產(chǎn)學(xué)研、校企合作為紐帶，以“鄉(xiāng)村振興”、“種業(yè)振興”、“生態(tài)文明建設(shè)”為契機，培養(yǎng)德、智、體、美、勞全面發(fā)展，具有“一懂兩愛”情懷的創(chuàng)新型、復(fù)合型應(yīng)用人才。

學(xué)院現(xiàn)有教職工63人，專任教師53人。其中：教授14人，副教授17人，研究員職稱5人，副研究員職稱7人，高級工程師、實驗師6人，高級職稱教師占比100%；博士33人，碩士及以上學(xué)位教師占比99%。教師隊伍中，雙師型教師10人，甘肅省科技特派員 17 人，張掖市科技特派員11人；2人獲甘肅省“555”創(chuàng)新人才，1人獲甘肅省園丁獎，1人獲甘肅省專利發(fā)明人獎，1人獲甘肅省技術(shù)發(fā)明三獎，1人入選“甘肅省領(lǐng)軍人才”，1人入選甘肅省隴原青年英才。

學(xué)院辦學(xué)條件優(yōu)越，現(xiàn)有甘肅省應(yīng)用真菌工程實驗室等三個科研平臺。有專業(yè)實驗室20余個，有基因庫、活體組織庫、菌種庫等5個保藏庫，標本館1個，標本陳列室3個，菌物文化館1個，教學(xué)科研儀器設(shè)備4200余萬元；有1個教學(xué)科研示范園和20余個產(chǎn)學(xué)研合作基地，先后與甘肅省農(nóng)科院、登海種業(yè)等多家單位簽訂戰(zhàn)略合作協(xié)議，并設(shè)立登海獎學(xué)金等3項企業(yè)獎助學(xué)金，以上辦學(xué)條件能滿足本科生和研究生教學(xué)及科研工作。

近5年來，學(xué)院教學(xué)科研成績顯著。有省級重點學(xué)科1個，省級一流專業(yè)建設(shè)點2個，省級教學(xué)團隊1個；爭取到國家自然科學(xué)基金項目7項，其他國家級項目5項，省、部級項目36項，地、廳級及橫向項目43項，獲科研總經(jīng)費5000余萬元，師均科研費達20萬元以上。發(fā)表各類學(xué)術(shù)論文209篇，其中SCI收錄期刊19篇；主參編教材8部。獲得甘肅省科技進步一等獎1 項、三等獎 2 項，甘肅省技術(shù)發(fā)明一等獎 1 項、三等獎2 項；甘肅省農(nóng)牧漁業(yè)豐收一等獎 2 項、二等獎 1 項等成果獎共 10 余項。

學(xué)院始終把提高學(xué)生考研率、考研質(zhì)量作為提升人才培養(yǎng)質(zhì)量、推進學(xué)風(fēng)建設(shè)、促進高質(zhì)量就業(yè)的重要舉措。近三年來，學(xué)生考研錄取率40%以上。