北京市心肺血管疾病研究所成立于1981年，由我國著名心血管疾病專家吳英愷院士創(chuàng)建，是以心、肺血管相關(guān)疾病防治的應(yīng)用基礎(chǔ)和臨床研究為主要方向的公益性研究所。北京市心肺血管疾病研究所從創(chuàng)建初期就與首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安貞醫(yī)院在行政管理和專業(yè)學(xué)科發(fā)展上形成了集醫(yī)，教、研、創(chuàng)，科學(xué)管理，文化建設(shè)六位一體化的全方位聯(lián)合體。

研究所現(xiàn)任領(lǐng)導(dǎo)主要有：張宏家所長兼院長、周玉杰常務(wù)副所長兼常務(wù)副院長、杜杰副所長、劉靜副所長。研究所辦公室負(fù)責(zé)協(xié)助所領(lǐng)導(dǎo)完成研究所各項(xiàng)行政事務(wù)性工作。研究所目前設(shè)有8個研究室，流行病研究室、心血管生物學(xué)研究室、上氣道功能障礙相關(guān)心血管疾病研究室、高血壓研究室、動脈粥樣硬化研究室、生物醫(yī)學(xué)工程研究室、人群防治研究室、藥理研究室。2個科研平臺：上呼吸道平臺和心血管病轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究平臺。2個科研服務(wù)平臺實(shí)驗(yàn)中心、實(shí)驗(yàn)動物中心。3個專業(yè)雜志編輯部《心肺血管病雜志》編輯部《北京生物醫(yī)學(xué)工程》雜志編輯部及《中華胸心血管外科雜志》編輯部。

2016年11月，北京市心肺血管疾病研究所B4實(shí)驗(yàn)室竣工。B4實(shí)驗(yàn)室位干門診樓地下4層，完全按照國際頂尖實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)設(shè)計。設(shè)30余間實(shí)驗(yàn)室，可同時容納260人開展實(shí)驗(yàn)。配有生物樣本庫、辦公室、會議室等，功能完備。實(shí)驗(yàn)室安全系統(tǒng)完備，各區(qū)域配置了監(jiān)控系統(tǒng)，并與中控室相連接。新風(fēng)系統(tǒng)噪音控制在40-50分貝，并安裝了新風(fēng)自控系統(tǒng)，可以滿足每個實(shí)驗(yàn)室的個性化需求。休息區(qū)可實(shí)現(xiàn)茶歇及小組課題討論功能。該實(shí)驗(yàn)室不僅能夠滿足研究人員科研工作，更能夠營造良好的工作環(huán)境，進(jìn)而打出北京安貞醫(yī)院和北京市心肺血管疾病研究所的品牌，達(dá)到國際化的水平。