自然資源部海島研究中心是中央編辦批準(zhǔn)設(shè)立的自然資源部直屬正局級事業(yè)單位，為國家公益一類綜合型海島科學(xué)研究與業(yè)務(wù)支撐機(jī)構(gòu)。主要從事海島戰(zhàn)略規(guī)劃政策研究與資源生態(tài)調(diào)查監(jiān)測評估、自然資源確權(quán)登記、生態(tài)保護(hù)修復(fù)及國際合作等業(yè)務(wù)，承擔(dān)國家海島管理數(shù)據(jù)庫、物種種質(zhì)資源庫與海島科技平臺建設(shè)工作，為全國海島保護(hù)利用管理提供支撐和保障。

海島是壯大海洋經(jīng)濟(jì)、拓展發(fā)展空間的重要依托，是保護(hù)海洋環(huán)境、維護(hù)生態(tài)平衡的重要平臺，是捍衛(wèi)國家權(quán)益、保障國防安全的戰(zhàn)略前沿。海島地理位置特殊，海島保護(hù)與利用類型多，涉及面廣，且國內(nèi)海島研究處于起步階段，亟需一個(gè)專門機(jī)構(gòu)為海島研究工作提供技術(shù)支撐。

2011年6月，時(shí)任原國家海洋局局長劉賜貴一行到平潭綜合實(shí)驗(yàn)區(qū)調(diào)研，提出依托國家海洋局第三海洋研究所在平潭設(shè)立海島中心，建成立足平潭島、服務(wù)海西和全國海島的綜合性海島科研機(jī)構(gòu)。同年11月，福建省海洋與漁業(yè)廳就此項(xiàng)工作進(jìn)展向福建省委、省政府做專題匯報(bào)，時(shí)任省委書記孫春蘭、副省長倪岳峰分別做出重要批示，要求地方政府協(xié)助做好相關(guān)工作。

2012年1月4日，時(shí)任原國家海洋局副局長陳連增主持對建設(shè)海島中心事項(xiàng)進(jìn)行專題研究。2月13日，劉賜貴局長在貫徹落實(shí)《平潭綜合實(shí)驗(yàn)區(qū)總體發(fā)展規(guī)劃》座談會上明確表示支持在平潭設(shè)立海島中心。同年8月17日，海島中心正式獲中央編辦批準(zhǔn)設(shè)立。10月，原國家海洋局與福建省政府簽訂了《關(guān)于建設(shè)國家海洋局海島研究中心的協(xié)議》，海島中心建設(shè)與發(fā)展步入正軌。

海島中心位于福建省平潭綜合實(shí)驗(yàn)區(qū)海壇島東南部，壇南灣田美澳沙灘北側(cè)，總體規(guī)劃用地面積為7.3萬平方米（約109.5畝），規(guī)劃總建筑面積為6.87萬平方米，依托平潭綜合實(shí)驗(yàn)區(qū)獨(dú)特的區(qū)位優(yōu)勢，在自然資源部和福建省人民政府的大力支持下，力爭建成集科學(xué)研究、生態(tài)保護(hù)、國際交流、科普教育為一體的科研業(yè)務(wù)基地。

海島中心現(xiàn)設(shè)有辦公室（財(cái)務(wù)資產(chǎn)處）、組織人事處（紀(jì)委辦公室）、政策規(guī)劃與國際合作處、調(diào)查登記與監(jiān)測評估處、保護(hù)修復(fù)與防災(zāi)減災(zāi)處5個(gè)部門。主要職責(zé)是：

（一）承擔(dān)全國無居民海島保護(hù)利用管理業(yè)務(wù)支撐。承擔(dān)用島項(xiàng)目的技術(shù)審查、使用金評估與開發(fā)利用后評估工作。承擔(dān)特殊用途海島保護(hù)管理的技術(shù)指導(dǎo)、數(shù)據(jù)匯總與評估。

（二）承擔(dān)海島保護(hù)利用戰(zhàn)略規(guī)劃、法律法規(guī)、政策制度、標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范的研究工作。

（三）承擔(dān)全國海島資源生態(tài)調(diào)查監(jiān)測評估的業(yè)務(wù)組織與質(zhì)量管理工作，承擔(dān)國家海島管理數(shù)據(jù)庫的建設(shè)與運(yùn)行。

（四）承擔(dān)全國無居民海島自然資源確權(quán)登記業(yè)務(wù)支撐及相關(guān)成果變更、更新等工作。

（五）承擔(dān)海島生態(tài)系統(tǒng)和生物多樣性保護(hù)修復(fù)技術(shù)支撐，開展海島海岸帶生態(tài)狀況與保護(hù)修復(fù)效果評估。承擔(dān)全國海島物種登記和典型物種種質(zhì)資源庫、標(biāo)本庫的建設(shè)與運(yùn)行。

（六）承擔(dān)海島海岸帶應(yīng)對氣候變化與防災(zāi)減災(zāi)技術(shù)支撐。開展海島海岸帶生態(tài)產(chǎn)品價(jià)值實(shí)現(xiàn)、生態(tài)補(bǔ)償機(jī)制研究。

（七）承擔(dān)海島地區(qū)社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展監(jiān)測評估與咨詢服務(wù)，編制發(fā)布全國海島可持續(xù)發(fā)展報(bào)告。承擔(dān)全國海島聯(lián)席會議組織協(xié)調(diào)工作。

（八）開展海島領(lǐng)域相關(guān)國際交流與合作。承辦中國-島嶼國家海洋高層論壇及相關(guān)工作，推動構(gòu)建海島藍(lán)色伙伴關(guān)系。承擔(dān)全球海島治理相關(guān)信息的研究分析與決策支撐。承擔(dān)海島科學(xué)研究工作和科技創(chuàng)新平臺建設(shè)。

（九）承辦部交辦的其他任務(wù)。