中國疾病預(yù)防控制中心研究生教育始于1984年，2014年成立研究生院，工作內(nèi)涵包括學(xué)位教育、繼續(xù)教育和特色培訓(xùn)等三個模塊。其中“特色培訓(xùn)”包括現(xiàn)場流行病學(xué)培訓(xùn)項目（CFETP）等。

中心有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)等2個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點，免疫學(xué)、病原生物學(xué)、放射醫(yī)學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)、兒少衛(wèi)生與婦幼保健學(xué)、衛(wèi)生毒理學(xué)等8個二級學(xué)科博士碩士學(xué)位授權(quán)點，以及公共衛(wèi)生博士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點，其中病原生物學(xué)被評為北京市重點學(xué)科。