航海學院于1992年9月由原航海系（成立于1953年）、電子工程系（成立于1962年）和航政系（成立于1989年）合并而成。

學院現(xiàn)有航海技術(shù)、海事管理、地理信息科學和安全工程四個本科專業(yè)，牽頭國家“雙一流”建設(shè)學科交通運輸工程學科，設(shè)有交通信息工程及控制、航海科學與技術(shù)和海上交通工程三個二級學科碩士和博士點，已形成博士、碩士、本科等多層次、多方式的辦學體系，以培養(yǎng)碩士研究生和本科生為主，并招收國外留學生。

航海技術(shù)專業(yè)在國內(nèi)外享有較高的知名度，是1953年并校時保留并進一步發(fā)展起來的重點專業(yè)，1992年被列為交通部“八五”首批重點建設(shè)學科專業(yè)，2006年被評為遼寧省高等學校示范性專業(yè)，2007年順利通過教育部組織的全國重點學科的重新評估，被確定為國家高等學校特色專業(yè)建設(shè)點，2008年獲批國家級航海類專業(yè)人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新示范區(qū)，2011年被列為遼寧省普通高等學校本科綜合改革試點專業(yè)，2013年列入教育部“卓越工程師”教育培養(yǎng)計劃專業(yè)。航海實驗實踐教學中心被評為國家及遼寧省普通高校實驗教學示范中心，2013年以航海技術(shù)專業(yè)為主的“海運工程虛擬仿真實驗教學中心”獲批國家級虛擬仿真實驗教學中心。2014年航海虛擬仿真實驗教學中心獲遼寧省虛擬仿真實驗教學示范中心建設(shè)立項。2017年，交通運輸工程學科進入國家“雙一流”建設(shè)學科名單，學校獲批成為國家“雙一流”學科建設(shè)高校。

學院下設(shè)航海、船藝、貨運、航海通信導航、船舶安全管理、航海英語、航海氣象、地理信息、海事管理、安全工程等教研室。航海實驗實踐教學中心下設(shè)船藝實驗室、航海實驗室、航海氣象實驗室、航海模擬器實驗室、船舶貨運實驗室、航海儀器實驗室、船舶保安實驗室、GMDSS實驗室、航海計算機中心、海事管理實驗室、地理信息系統(tǒng)實驗室11個實驗室。學院擁有1個國家地方聯(lián)合工程研究中心，1個省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心，2個交通運輸行業(yè)重點實驗室，3個省級重點實驗室，1個省級工程技術(shù)研究中心。

學院師資力量雄厚，擁有國家級教學團隊1個，省級教學團隊2個，科技部創(chuàng)新人才推進計劃重點領(lǐng)域創(chuàng)新團隊1個，省級教學名師6人，校級教學名師8人，具有教授、副教授高級專業(yè)技術(shù)職稱的人員占教師總數(shù)一半以上，形成了以國內(nèi)外航海界知名度高、影響大、學術(shù)造詣深的教授為帶頭人，以具有博士、碩士學位的中青年骨干教師為主力的多支學術(shù)梯隊。航海學院現(xiàn)有教師186人，其中教授44人、副教授73人，實驗技術(shù)人員15人。24人持有符合國際海員培訓發(fā)證值班標準的船長證書或高級船長證書，25人持有大副證書。

學院擁有較強的科研實力，主要研究方向包括海上信息工程、船舶運動控制、航海仿真、海上智能運輸工程、船舶運輸安全保障技術(shù)、船舶導航技術(shù)、船舶智能駕駛技術(shù)、船舶貨運安全、海上交通理論與應(yīng)用技術(shù)、海上交通安全監(jiān)督管理技術(shù)、海上交通安全分析與應(yīng)急管理技術(shù)、航道通過效率與交通組織技術(shù)等。近10年來，學院累計完成科研項目近兩千項，到款額近7億元，2013年突破1億元。同時，學院還承擔了多項國家自然科學基金、交通運輸部及部屬單位的科研項目，眾多研究成果處于國內(nèi)領(lǐng)先或達到國際先進水平，獲得業(yè)界的廣泛好評。2007年，趙德鵬教授主持的“電子海圖及其應(yīng)用系統(tǒng)”獲得國家科技進步二等獎；2008年，金一丞教授主持的“多本船功能完備的航海模擬系統(tǒng)及其開發(fā)平臺”獲得國家科技進步二等獎；2013年，李穎教授主持的“岸船空基海上油膜探測傳感識別技術(shù)及應(yīng)用”獲得國家技術(shù)發(fā)明二等獎，為我國航海科技水平的提高和海洋強國戰(zhàn)略的不斷推進做出了重要貢獻。

作為國家高級航運人才的重要培養(yǎng)基地，學院與世界海事大學、麻省海運學院等世界知名海事院校建立了合作辦學關(guān)系，先后選派4名優(yōu)秀教師（船長）參與亞丁灣護航，被譽為“亞丁灣上好園丁”。學院積極鼓勵教師參與國內(nèi)外學術(shù)交流、訪問和進修，多人成為國內(nèi)外重要學術(shù)組織的主要成員及國際海事組織的專家顧問。